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liyongrui1铁杆木虫 (著名写手)
木虫
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[求助]
转录组测序的生物学重复问题 已有10人参与
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现在进行转录组测序是否必须进行生物学重复啊，是否要3个重复。是否可以用3个样品的RNA等量混合代替生物学重复？如果不重复能否发文章？主要是经费有限 |
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liuzhenhai
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6楼2014-06-18 20:01:09
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【答案】应助回帖
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liyongrui1(西门吹雪170代发): 金币+3, 鼓励回帖交流 2014-06-18 10:40:02
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liyongrui1(西门吹雪170代发): 金币+3, 鼓励回帖交流 2014-06-18 10:40:02
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最近一直在琢磨这个问题。现在基本上测转录组数据都没有生物学重复，见了几个之前做芯片的客户，想做测序，问我测序技术为什么不需要生物学重复，我一时还真没回答上来。 实际来看，绝大多数发表的转录组文献都不做生物学重复，再有就是测序的成本还是挺高的，所以大家默认都不做生物学重复。 给你一个文献看看吧： Sequencing technology does not eliminate biological variability. Kasper D Hansen, Zhijin Wu, Rafael A Irizarry & Jeffrey T Leek. Nat Biotechnol., 2011. 29(7): 572–573. |
2楼2014-06-18 10:36:47
jurkat.1640
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