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306495799

铁虫 (小有名气)

[求助] 复杂模板,pcr,求指导??? 已有5人参与

复杂模板,染色体脆性位点附近,全基因组PCR换了6对对引物p不出来,主要是杂带太多,主带不明显,切胶回收再进行巢式pcr也试了,同一对引物巢式pcr产物切胶回收测序结果也不对,,换更短片段的引物做巢式pcr主带基本看不见了,杂带还是很多,求指导???我要扩增产物必须包括360~560大小
http://muchong.com/bbs/post.php?action=newthread&fid=366

>gi|568815591|ref|NC_000007.14|:128207397-128208617 Homo sapiens chromosome 7, GRCh38 Primary Assembly
1        GTGGGAACTG GGTGTACTGA CACTGTGGAA CCAAGGAAGC ACCACGGCTG CAGAGAGACC
61       CTGGGCCAGA CCATCCAAAT GAAGCCCAGG CACAGCAGAG GGCTCTGAGG AGGCGCAGGA
121      TGCAGGAGAT GAAAGGGGAA AATGAAGGGG AGCCGCAGGT TCAAACTGCC CCTTCCCAGG
181      AGTGAGCTAC AGCTTGGCCA CTTCTGTCTC ATAAGAAGGA GGTTGTGACT TTGGGAGGTG
241      GAGGGGGATT ACAGCTGGGA TTCCTGTTGC CTGCCTCCTG CCTCTGGGGC TCTCAGCTTT
301      CTCTTCTCCC CAGGACTCTT TTCTTCCTCT CCCCCCACCT CCCCCCCCAC TCCCCTCCTC
361      CCCCTAGGTC CTGGCTCTCC CTCCCCGACC CGGTCTTCTT GGTACCAGCT AAGCCCTGGA
421      GGGGCCACAG CCTCCCCTCC AGCCCCCCTG CCATGGGATG GCTGCTGTCT CCTTTGGATC
481      TTTTTGCGGT CTGGGCTTGC TGTTCCTCTC AACAGTAGTC AGGAAGCCCT TACCCCAAAA
541      AGTATCTGCG GGAGGCCTTG TCCACAGGGG AGGCTGCCCC AAGGGCTCCA GGTGAGTCAC
601      AGCAAACCCA AGAACAGTGA ATGGAACTGG GGTCTCCTGG CTCTCCTTTA GAGTTGCTGA
661      GTGACTTTAA GTCCAGCACT GAGCCTCTCT GGGCCTCACT TATGCCACTC TTTTCATCAT
721      TTACCAGTGG GCAATGTCAA GTGAGAGACT CCACAGATAA GAAAAATAAA GGAGTGGCTC
781      AATTACATGC CAGGGAAAAC CGCTTTGGTG GATGAAGGTC ACACAGCTCT CCCAGCATTC
841      TGTCCTCTGT ATACAGATGA TCTCCTTCTG AAATCCTTTT GGGGATGACC CCCTTCCACA
901      CCATGGACAC TTCTGGGTGG GTTGTCACTC AAGAGGTCCT GCCCTCTTCT GCCCACTGGG
961      TGGACACAAG AATTGAAATC TGTAAAGGAT ACTGAGATTG GGAACAAAAT AATTGATGCT
1021     GATTGATCCC AGCAGTGTAT GGCGAGAAGA TGACAAGCTT CCACTGCCTG TATCACTGAC
1081     TTGCCTAATG TCTGCCCTGC CCTGGCCTGG ATCTTAACCG CGCCCTTCAT TCTGTGAACT
1141     ACCCCCAAAT CCTTCAAATA AAGTCCTTGA TTGCTTGTTA GAGTCAATAA TATTGCTTGC
1201     TGAGGATCCA GAGACCTCTA G
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也许似乎大概是,然而未必不见得
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愚者517

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
306495799(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-07-04 08:53:53
1.首先引物必须符合设计原则,引物需与模板特异性结合。
2.你的模板很长,需要调节退火温度。
3.提高琼脂糖凝胶的浓度,由0.8%提高到1%.
16楼2014-06-12 15:54:59
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