| 查看: 3572 | 回复: 30 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
zhen_fang银虫 (正式写手)
|
[交流]
大家在做蛋白同源模拟的时候，如何把不同结构域的分别建模连接到一起？
|
||
|
我正在学习做同源建模，目标序列比对时，发现前面300多氨基酸与A蛋白有最高47%相似性，而后面100个氨基酸与B蛋白有较高的相似性36%。我的蛋白有两个区域，前面300个氨基酸和后面100个氨基酸。请问这种情况，我如果选择根据AB蛋白分别建模，获得的不同区域结构模型，我如何将他们连在一起？然后可以继续做MD等后续工作。 有什么方法或者软件可以完成？谢谢了。easymodeller我也在用，可是里面的aglinment在序列比对时，后面的100氨基酸结构总不能和目标序列重合比对。。。 |
回复此楼» 猜你喜欢
0854 考研调剂 招生了！AI 方向
已经有14人回复
-
328求调剂
已经有3人回复
-
一志愿重庆大学085700资源与环境，总分308求调剂
已经有5人回复
-
招08考数学
已经有14人回复
-
一志愿上海交大生物与医药专硕324分，求调剂
已经有4人回复
-
0854电子信息求调剂 324
已经有3人回复
-
303求调剂
已经有3人回复
-
336求调剂
已经有3人回复
-
306求调剂
已经有9人回复
-
工科0856求调剂
已经有4人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 候选抗病ESTblastx后，怎么知道是否含有抗病基因保守结构域NBS、LRR之类？
已经有8人回复
- 求助！蛋白质同源建模，模板不是同工酶，而且相似性低于30%，下一步怎么办？
已经有12人回复
- 蛋白质三级结构结构模建
已经有3人回复
- 怎样对一个酶进行同源建模，能分析出合理的突变位点
已经有11人回复
- 关于PDB中蛋白结构
已经有4人回复
- 怎样进行蛋白质高级结构的比对分析
已经有7人回复
- 同源建模时怎样计算一致性和相似性
已经有4人回复
- 蛋白的同源建模
已经有5人回复
- 同源建模之----分别建模
已经有7人回复
- 求助，已有PDB结构的DS同源建模步骤，谢谢
已经有11人回复
- 同源建模，希望建的蛋白质结构，N端和C端分别使用不同的蛋白模版，请教
已经有11人回复
- 求助：本人新手，想分段同源建模，不知道用什么软件和方法？
已经有11人回复
- 请教大家，跨膜蛋白的同源建模，遇到了困难
已经有3人回复
- 关于同源建模预测蛋白三维结构
已经有4人回复
- swiss model上怎么做二聚体的同源建模
已经有5人回复
- 【求助】在swiss model 同源建模以后得到的结果怎么分析
已经有8人回复
- 【求助】从同源建模开始，一个完整的分子对接实验需要多久？
已经有7人回复
- 【讨论】分子模拟还是同源建模
已经有16人回复
- 【求助】modeller同源建模结果选择
已经有10人回复
- 【求助】蛋白质建模没有同源模板怎么解决？
已经有11人回复
- 【讨论】同一蛋白质分成不同部分建模得到的结构如何生成一个结构?
已经有9人回复
★
zhen_fang(金币+1): 谢谢参与
zhen_fang(金币+1): 谢谢参与
  |
4楼2014-05-21 11:03:30
★
zhen_fang(金币+1): 谢谢参与
zhen_fang(金币+1): 谢谢参与
|
|
3楼2014-05-21 10:57:47
