应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 专家会诊 » 同源建模时怎样计算一致性和相似性
51/1返回列表
查看: 1437  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

patent

至尊木虫 (正式写手)

[求助] 同源建模时怎样计算一致性和相似性

同源建模时将蛋白质的氨基酸进行比对，请问怎样计算一致性和相似性？具体的数值(如20%)是怎样得到的？谢谢!!
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

药物设计资料

» 猜你喜欢
1楼 2012-11-22 22:08:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
patent: 金币+20, ★★★★★最佳答案, 谢谢!!! 2012-11-23 16:05:45
blast一下两者的氨基酸序列就可以了~
赞一下 回复此楼
2楼2012-11-22 22:10:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

patent

至尊木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zh1987hs at 2012-11-22 22:10:24
blast一下两者的氨基酸序列就可以了~

有什么软件可以计算吗
赞一下 回复此楼
3楼2012-11-23 07:52:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

patent

至尊木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by patent at 2012-11-23 07:52:59
有什么软件可以计算吗...

Score =   206 bits (525),  Expect = 6e-68, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 101/154 (66%), Positives = 120/154 (78%), Gaps = 0/154 (0%)

blast后有如上结果，请问Positives = 120/154 (78%)是指相似性吗？
赞一下 回复此楼
4楼2012-11-23 08:07:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手
引用回帖:
4楼: Originally posted by patent at 2012-11-23 08:07:11
Score =   206 bits (525),  Expect = 6e-68, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 101/154 (66%), Positives = 120/154 (78%), Gaps = 0/154 (0%)

blast后有如上结果，请问Positives = 120/1 ...

是的！哈哈~~~
回复此楼
5楼2012-11-23 08:19:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 patent 的主题更新
51/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭