应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 专家会诊 » 同源建模时怎样计算一致性和相似性
51/1返回列表
查看: 1470  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

patent

至尊木虫 (正式写手)

[求助] 同源建模时怎样计算一致性和相似性

同源建模时将蛋白质的氨基酸进行比对，请问怎样计算一致性和相似性？具体的数值(如20%)是怎样得到的？谢谢!!
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

药物设计资料

» 猜你喜欢
1楼 2012-11-22 22:08:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
patent: 金币+20, ★★★★★最佳答案, 谢谢!!! 2012-11-23 16:05:45
blast一下两者的氨基酸序列就可以了~
赞一下 回复此楼
2楼2012-11-22 22:10:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

patent

至尊木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zh1987hs at 2012-11-22 22:10:24
blast一下两者的氨基酸序列就可以了~

有什么软件可以计算吗
赞一下 回复此楼
3楼2012-11-23 07:52:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

patent

至尊木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by patent at 2012-11-23 07:52:59
有什么软件可以计算吗...

Score =   206 bits (525),  Expect = 6e-68, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 101/154 (66%), Positives = 120/154 (78%), Gaps = 0/154 (0%)

blast后有如上结果，请问Positives = 120/154 (78%)是指相似性吗？
赞一下 回复此楼
4楼2012-11-23 08:07:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手
引用回帖:
4楼: Originally posted by patent at 2012-11-23 08:07:11
Score =   206 bits (525),  Expect = 6e-68, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 101/154 (66%), Positives = 120/154 (78%), Gaps = 0/154 (0%)

blast后有如上结果，请问Positives = 120/1 ...

是的！哈哈~~~
回复此楼
5楼2012-11-23 08:19:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 patent 的主题更新
51/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 时间戳又变了 +11 wuchongjun 2026-08-20 16/800 2026-08-20 19:26 by wuchongjun
[基金申请] 科研孤儿太难了 +9 我4大白菜 2026-08-20 9/450 2026-08-20 18:23 by 2549091707
[基金申请] 时间戳变了，能看出什么问题？ +18 基诺咪客 2026-08-17 23/1150 2026-08-20 17:19 by Godzela
[基金申请] 今天系统多次维护，明天很可能放榜！ +9 zju2000 2026-08-16 10/500 2026-08-20 15:56 by Leogzhya
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+3 snowwithsea 2026-08-19 12/600 2026-08-20 15:56 by lfy8008
[基金申请] 言之凿凿，明天官网会通知放榜？ +14 医学老男孩 2026-08-20 16/800 2026-08-20 15:47 by LNP@mRNA
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜？ +16 Ldrop2023 2026-08-13 20/1000 2026-08-20 11:07 by xskun
[基金申请] 今天基金会出结果吗？20260819 +14 kkkl_v 2026-08-19 15/750 2026-08-20 08:21 by sunzitan
[基金申请] filecode，4个jtjc了 +11 ziyangfang 2026-08-19 13/650 2026-08-19 21:28 by aasahr
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低？主要原因有哪些？ +5 瞬息宇宙 2026-08-15 5/250 2026-08-19 20:23 by super2002521
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +4 yuleib84 2026-08-19 5/250 2026-08-19 19:52 by hhs666
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +10 wangze12014 2026-08-14 12/600 2026-08-19 16:56 by 苦难博士
[基金申请] 2027广东省杰青 +4 奶牛小黑 2026-08-15 10/500 2026-08-19 11:02 by wanfengnew
[基金申请] 快农历七夕节了，轻松一下，男人悄悄话，女施主请不要进来。 +6 Tide man 2026-08-14 7/350 2026-08-19 09:56 by ZJTJZ
[基金申请] 什么时候开奖？ +6 CrisMessi 2026-08-18 6/300 2026-08-19 08:06 by Equinoxhua
[基金申请] 明天放榜？ +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[论文投稿] 投稿咨询 +4 wwm09 2026-08-17 6/300 2026-08-18 15:36 by wwm09
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +14 archvillain 2026-08-15 26/1300 2026-08-18 13:37 by phantomgost
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +6 angus9576 2026-08-17 11/550 2026-08-17 23:57 by angus9576
[基金申请] 各位道友，我要去昆明玩几天，回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭