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西门吹雪170

荣誉版主 (职业作家)

[求助] 请教启动子序列预测方法 已有4人参与

现已扩增一基因的基因组前端序列,求助各位大神如何预测此序列的启动子,以及转录起始位点和转录因子结合位点?不甚感激!!!
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植根于内心的修养;无需提醒的自觉;以约束为前提的自由;为别人着想的善良
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西门吹雪170

荣誉版主 (职业作家)

引用回帖:
3楼: Originally posted by meng_xu at 2014-04-30 05:41:07
什么物种呢?
如果是大肠杆菌的话,你可以看看ecocyc和regulonDB

真核的
植根于内心的修养;无需提醒的自觉;以约束为前提的自由;为别人着想的善良
4楼2014-04-30 09:23:00
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biology-boy

禁虫 (正式写手)


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2014-04-29 21:11:15
本帖内容被屏蔽

2楼2014-04-29 19:51:53
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meng_xu

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
什么物种呢?
如果是大肠杆菌的话,你可以看看ecocyc和regulonDB
3楼2014-04-30 05:41:07
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西门吹雪170

荣誉版主 (职业作家)

引用回帖:
2楼: Originally posted by biology-boy at 2014-04-29 19:51:53
你百度一下 有两个预测启动子的 网站 需要把结果综合一下分析 大概就能找到启动子了。

能否讲详细点?我已经试过好几个了,但是感觉结果不一致,而且转录因子结合位点的只找到一种预测方法,求赐教
植根于内心的修养;无需提醒的自觉;以约束为前提的自由;为别人着想的善良
5楼2014-04-30 09:24:42
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