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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 怎样获取一个基因的CDS序列
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潘蕾

新虫 (初入文坛)

[求助] 怎样获取一个基因的CDS序列 已有3人参与

目前要克隆一个基因CDS序列，但是在ncbi上面只能找到该基因的基因组序列，请问我改怎样找到CDS序列！？？敬请各位大神告知，不甚感激
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1楼 2014-03-11 13:54:07
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
潘蕾(gyesang代发): 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-03-31 19:38:12
你需要的是这个基因吧：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/100355978。要不是就把基因的名字给我。
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7楼2014-03-12 13:31:52
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li123h

铜虫 (初入文坛)
★ ★
潘蕾(gyesang代发): 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-03-31 19:38:20
enzembl数据库，找rabbit，输入notch1, 链接http://uswest.ensembl.org/Oryctolagus_cuniculus/Transcript/Sequence_cDNA?db=core;g=ENSOCUG00000026591;r=GL018710:1300846-1622357;t=ENSOCUT00000031868
上面链接请楼主重新确认是否正确，上面直接是序列链接，我怕可能在你那有变动。
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

潘蕾
10楼2014-03-12 21:17:41
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普通回帖

匿名

用户注销 (著名写手)
★
潘蕾(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-03-13 18:43:20
本帖仅楼主可见
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2楼2014-03-11 15:32:18
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KEVIN_LOVE

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
潘蕾(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖交流！ 2014-03-31 19:38:30
NCBI中查找的基因都会有对应的CDS序列，而且还有对应的氨基酸序列。请楼主仔细查找一下。
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3楼2014-03-11 15:44:38
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lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-03-12 00:29:12
NCBI上对序列都有分析，一般在序列前有一系列英文及符号介绍这段序列。一般显示DNA，mRNA，CDS你点CDS就可以了。
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hehe
4楼2014-03-11 20:12:29
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潘蕾

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by pf790352975 at 2014-03-11 15:32:18
进入NCBI  搜索框输入你要查询的基因 就会查到基因 的碱基序列还有CDs 区域

我要得这个基因没有？http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NW_003159336.1请帮忙看看     ？谢谢
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5楼2014-03-11 22:08:48
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潘蕾

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by KEVIN_LOVE at 2014-03-11 15:44:38
NCBI中查找的基因都会有对应的CDS序列，而且还有对应的氨基酸序列。请楼主仔细查找一下。

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NW_003159336.1这是我需要的基因在NCBI上的信息，请指教！
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6楼2014-03-11 22:10:06
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潘蕾

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by liuderong at 2014-03-12 13:31:52
你需要的是这个基因吧：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/100355978。要不是就把基因的名字给我。

notch1 rabbit
谢谢
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8楼2014-03-12 19:50:06
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潘蕾

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by KEVIN_LOVE at 2014-03-11 15:44:38
NCBI中查找的基因都会有对应的CDS序列，而且还有对应的氨基酸序列。请楼主仔细查找一下。

我要查找的这个基因还真的没有！notch1 家兔的
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9楼2014-03-12 20:55:20
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