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潘蕾

新虫 (初入文坛)

[求助] 怎样获取一个基因的CDS序列 已有3人参与

目前要克隆一个基因CDS序列,但是在ncbi上面只能找到该基因的基因组序列,请问我改怎样找到CDS序列!??敬请各位大神告知,不甚感激
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
潘蕾(gyesang代发): 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-03-31 19:38:12
你需要的是这个基因吧:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/100355978。要不是就把基因的名字给我。
7楼2014-03-12 13:31:52
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li123h

铜虫 (初入文坛)

★ ★
潘蕾(gyesang代发): 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-03-31 19:38:20
enzembl数据库,找rabbit,输入notch1, 链接http://uswest.ensembl.org/Oryctolagus_cuniculus/Transcript/Sequence_cDNA?db=core;g=ENSOCUG00000026591;r=GL018710:1300846-1622357;t=ENSOCUT00000031868
上面链接请楼主重新确认是否正确,上面直接是序列链接,我怕可能在你那有变动。

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10楼2014-03-12 21:17:41
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普通回帖

匿名

用户注销 (著名写手)

★
潘蕾(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-03-13 18:43:20
本帖仅楼主可见
2楼2014-03-11 15:32:18
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KEVIN_LOVE

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与,应助指数 +1
潘蕾(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖交流! 2014-03-31 19:38:30
NCBI中查找的基因都会有对应的CDS序列,而且还有对应的氨基酸序列。请楼主仔细查找一下。
3楼2014-03-11 15:44:38
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lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-03-12 00:29:12
NCBI上对序列都有分析,一般在序列前有一系列英文及符号介绍这段序列。一般显示DNA,mRNA,CDS你点CDS就可以了。
hehe
4楼2014-03-11 20:12:29
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潘蕾

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by pf790352975 at 2014-03-11 15:32:18
进入NCBI  搜索框输入你要查询的基因 就会查到基因 的碱基序列还有CDs 区域

我要得这个基因没有?http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NW_003159336.1请帮忙看看     ?谢谢
5楼2014-03-11 22:08:48
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潘蕾

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by KEVIN_LOVE at 2014-03-11 15:44:38
NCBI中查找的基因都会有对应的CDS序列,而且还有对应的氨基酸序列。请楼主仔细查找一下。

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NW_003159336.1这是我需要的基因在NCBI上的信息,请指教!
6楼2014-03-11 22:10:06
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潘蕾

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by liuderong at 2014-03-12 13:31:52
你需要的是这个基因吧:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/100355978。要不是就把基因的名字给我。

notch1 rabbit
谢谢
8楼2014-03-12 19:50:06
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潘蕾

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by KEVIN_LOVE at 2014-03-11 15:44:38
NCBI中查找的基因都会有对应的CDS序列,而且还有对应的氨基酸序列。请楼主仔细查找一下。

我要查找的这个基因还真的没有!notch1 家兔的
9楼2014-03-12 20:55:20
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