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wenzwl

木虫 (小有名气)

[求助] 请问,有做虚拟RNA-RNA互作的高人吗?特别是多RNA互作 已有1人参与

我们实验室现在遇到了一个难题,实验手段解决不了,想问问有没有这样的算法或是什么别的,可以计算多个RNA在一起的互作。如果有从事此领域的专家,请交流些相关信息。
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scybhmu老谭

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
wenzwl(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-04-12 17:11:18
我们组做过RNA-RNA/RNA-Protein interaction database,这个数据库的数据是基于文献挖掘的,不知道对你的课题有没有帮助,估计再过两个月就应该能发表出来了。
2楼2014-04-12 14:13:12
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wenzwl

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by scybhmu老谭 at 2014-04-12 14:13:12
我们组做过RNA-RNA/RNA-Protein interaction database,这个数据库的数据是基于文献挖掘的,不知道对你的课题有没有帮助,估计再过两个月就应该能发表出来了。

我主要是想进行定量的比较。
我们在说实验的时候,发现,同样是一个micro的靶基因,在细胞中加入相同浓度的micro,这两个靶基因的对应蛋白表达差别很大,一个根本不降低,另一个基本上没有条带了。很奇怪,所以我们想是不是亲和能的问题。
3楼2014-04-15 06:38:04
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