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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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zzq770204

至尊木虫 (著名写手)

[交流] 【求助/交流】求助:那种方法提取RNA浓度比较高? 已有13人参与

本人拟构建个均一化cDNA文库,需要的RNA量比较多,因此需要比较高的浓度。采用安比奥的试剂盒提取出的RNA浓度太低了,在逆转录和扩增时间的PCR次数太多了,难以满足要求。但是看别人用TRzol抽提由于时间长,很容易降解。请问哪种方法或试剂盒比较好?麻烦指点下,谢谢!

[ Last edited by zzq770204 on 2010-7-29 at 21:18 ]
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zhangzhuang

银虫 (初入文坛)

zzq770204(金币+6): 2010-07-22 14:36:50
你的引物,还有扩增条件的优化
2楼2010-07-21 11:43:11
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won7

金虫 (小有名气)

zzq770204(金币+10): 2010-07-22 14:36:35
“扩增后纯化”是什么意思?是actin扩增后纯化吗?如果是的话,那多半是你的纯化试剂或步骤有问题。clontech构建未剪切文库让公司帮忙,3万元基本可以搞定。
3楼2010-07-21 11:43:53
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sunyongle1

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★
amisking(金币+4):鼓励交流! 2010-07-21 18:08:00
zzq770204(金币+10): 2010-07-22 14:36:11
不见得是RNA的问题,RNA只要降解不是很厉害,就能满足普通的反转录,扩个Actin还是没有问题的。但是如果要建库,就要保证RNA的质量和反转录的质量。
你们实验室不缺钱的话,还是交给公司吧。也就两三万,自己做很费劲,质量也很难保证。
4楼2010-07-21 14:57:54
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香菱儿

铁杆木虫 (著名写手)


看天(金币+1):鼓励交流 2010-07-22 12:14:14
zzq770204(金币+10): 2010-07-22 14:36:03
clontech的这个试剂盒没用过。
能否具体描述一下呢?
(1)total RNA应该电泳检测的,如果再纯化mRNA的话,也应该电泳及分光光度法检测,RNA总量有多少,以及质量好坏应该能判断吧。
(2)对逆转录的产物进行扩增,用的是通用引物吗?采用纯化试剂盒纯化,然后割胶回收吗?
漫洒英雄泪,相离处士家。谢慈悲剃度在莲台下。没缘法转眼分离乍。赤条条来去无牵挂。那里讨烟蓑雨笠卷单行?一任俺芒鞋破钵随缘化!
5楼2010-07-22 12:02:00
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winscavin

木虫 (正式写手)

zzq770204(金币+3): 2010-07-23 08:48:22
实在不行就测序看看吧
6楼2010-07-22 21:03:59
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super1998

金虫 (小有名气)

★ ★
zzq770204(金币+10):你是试剂公司还是? 2010-07-24 20:17:18
zzq770204(金币+10): 2010-07-30 12:54:51
lstt09nk(金币+2):鼓励交流~~ 2010-08-02 17:18:22
首先不明白你扩增目的基因后为什么要纯化?扩完了可以直接电泳。
如果反转录可以扩增ACTIN,说明模板质量还行,但是没看到你的RNA,也不知道你的材料来源,因此无法确定能否满足建库的要求。
我给你几个建议,如果你的CDNA模板量足够大,可以选择1-2lu跑个电泳看看。如果看到清晰弥散条带,那就是扩增环节的问题,跟你的模板无关了。
试试看用其他模板是否可以扩增?修改一下你的PCR条件,特别是退火温度。
找公司做文库,犯不上,现在这个已经很普及了,如果实验室有钱可以选择,毕竟省事,我们这边5K-2w不等,看你要多大的文库了。
123
7楼2010-07-24 15:37:38
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super1998

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by super1998 at 2010-07-24 15:37:38:
首先不明白你扩增目的基因后为什么要纯化?扩完了可以直接电泳。
如果反转录可以扩增ACTIN,说明模板质量还行,但是没看到你的RNA,也不知道你的材料来源,因此无法确定能否满足建库的要求。
我给你几个建议,如 ...

我是学生,呵呵,我得意思是我们学校这边,公司是这个价格。
123
8楼2010-07-25 20:52:30
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super1998

金虫 (小有名气)

★ ★
reasonspare(金币+2):你的诚恳的帖子,值得我诚恳的加分。 2010-07-31 05:12:39
zzq770204(金币+10): 2010-07-31 22:48:04
引用回帖:
Originally posted by zzq770204 at 2010-07-21 10:46:04:
本人拟构建个均一化cDNA文库,需要的RNA量比较多,因此需要比较高的浓度。采用安比奥的试剂盒提取出的RNA浓度太低了,在逆转录和扩增时间的PCR次数太多了,难以满足要求。但是看别人用TRzol抽提由于时间长,很容易 ...

呵呵,先谢谢你的金币,这个帖子,无需金币,我也可以回答你。对于提大量RNA,目前已知的就是TRIZOL了,这个方法用的最广,最经典,至于你说的时间长降解,只要你按步骤完成,降解一点没关系的。你是要抽提什么材料的RNA?不同材料,提取差异化很大,有些组织容易提,有些植物的就很难提,包括材料的复杂程度,是否多糖,多沉淀,等等,都是考虑的因素。但是总体而言,TRIZOL是最好的方法了。可是多试几次,掌握方法就可以。不难的
123
9楼2010-07-31 02:50:01
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szxy520

木虫 (著名写手)

zzq770204(金币+6): 2010-07-31 22:48:10
用TRzol可以了吧
10楼2010-07-31 07:10:58
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