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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 新手请教amber力场问题
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jlsdyac

木虫 (正式写手)

[求助] 新手请教amber力场问题 已有1人参与

小弟新手，想用amber力场算吡啶离子液体，查了半天文献，只查到个“opls-aa/amber”力场，请问这个与纯amber力场一样吗？如果不一样，请哪位前辈赐给篇文献，我太笨实在找不到了。。。谢谢
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1楼 2014-03-17 22:03:03
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tim562944200

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-03-18 16:34:36
jlsdyac: 金币+10, ★★★很有帮助 2014-03-18 19:26:04
A Second Generation Force Field for the Simulation of
Proteins, Nucleic Acids, and Organic Molecules

看看这个行不行
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2楼2014-03-17 22:56:41
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jlsdyac

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by tim562944200 at 2014-03-17 22:56:41
A Second Generation Force Field for the Simulation of
Proteins, Nucleic Acids, and Organic Molecules

看看这个行不行

非常感谢。能帮忙解释一下用哪个吗？刚接触MD才3天，不太会找，麻烦了。
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3楼2014-03-18 19:25:47
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tim562944200

金虫 (小有名气)
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-03-19 20:21:32
引用回帖:
3楼: Originally posted by jlsdyac at 2014-03-18 19:25:47
非常感谢。能帮忙解释一下用哪个吗？刚接触MD才3天，不太会找，麻烦了。...

我给你的是一篇文献的题目，那里边是用amber力场对一些物质的模拟过程，并附有具体的力场参数。自己下载查查就行
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4楼2014-03-18 19:30:13
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