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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 怎样获得反向序列
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菜菜0929

木虫 (小有名气)

[求助] 怎样获得反向序列 已有2人参与

我的电脑装不上primer5，装了一个primer6，但是primer6粘贴序列的时候，没有反向、方向互补的选项，请教primer6上怎么得到反向序列？或者其他软件也行，只是除了primer5
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你所浪费的今天是昨天死去的人所奢望的明天，你所厌恶的现在是你回不去的曾经，活在当下
1楼 2014-03-16 18:25:53
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bright8

铁杆木虫 (著名写手)
在工具ToolS里面有一个Calculator可以把序列反向，互补等
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9楼2017-01-07 15:24:56
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Lau_Kimura

铁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-03-17 10:26:18
菜菜0929: 金币+2, 谢谢 2014-03-17 14:21:44
关于普通PCR的引物设计，老板总会说：你要知道，你比软件聪明多了。还用什么设计软件？

在目标区域的侧翼序列观察剪辑分布均匀的18-25bp小片段，注意引物之内和之间不能有连续4个碱基互补，3‘端不能连续3个碱基互补，最后一个碱基最好不是A；然后，将引物用NCBI数据库Blast，查看引物特异性，引物3‘端不断移动，直至寻找到特异性的引物为止。但反向序列要反转，可选用DNAMAN，DNAStar辅助，眼疾手快的也可自行手写，20多bp而已。

PS：引物合成也不值几个钱了，即使一时半会不行，多实践几次就上手了。
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2楼2014-03-16 18:51:54
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菜菜0929

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by Lau_Kimura at 2014-03-16 18:51:54
关于普通PCR的引物设计，老板总会说：你要知道，你比软件聪明多了。还用什么设计软件？

在目标区域的侧翼序列观察剪辑分布均匀的18-25bp小片段，注意引物之内和之间不能有连续4个碱基互补，3‘端不能连续3个碱基 ...

哦，我关键是测序出来的序列，有3‘-5’方向的和5‘-3’方向的，一批，要是自己一个一个找就麻烦了点
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你所浪费的今天是昨天死去的人所奢望的明天，你所厌恶的现在是你回不去的曾经，活在当下
3楼2014-03-16 19:15:34
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Lau_Kimura

铁虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 菜菜0929 at 2014-03-16 19:15:34
哦，我关键是测序出来的序列，有3‘-5’方向的和5‘-3’方向的，一批，要是自己一个一个找就麻烦了点...

测序结果分析？——不是很懂“一个一个找”是什么意思，你不是用参考序列吗？用DNAMAN等软件，用多序列比对就行了。
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4楼2014-03-16 19:35:15
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