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雪花爱上梅花

铜虫 (小有名气)

[求助] 求助,NCBI设计的引物怎么看好不好?急呀。。。。。 已有1人参与

如图,先谢谢了!

求助,NCBI设计的引物怎么看好不好?急呀。。。。。
20140313204524.jpg
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lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 叶叶梦 at 2015-01-20 22:40:28
你好,这个软件不会用,请赐教...

把你设计的引物复制到最上面的空白格处,点calculate会计算出引物的信息在下面你可以看到引物长度,Tm值及GC含量。最下面有一个Check self-complementarity,
会在新的页面显示引物有没有二级结构。
hehe
6楼2015-01-21 10:06:15
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查看全部 6 个回答

lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
雪花爱上梅花: 金币+2, ★★★很有帮助 2014-03-13 22:56:05
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-03-14 09:22:20
你用http://www.basic.northwestern.edu/biotools/oligocalc.html这个网址上的软件测试一下,GC含量38-60就可以,再看看有没有互补或高级结构。
hehe
2楼2014-03-13 21:13:18
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雪花爱上梅花

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lvbobo823 at 2014-03-13 21:13:18
你用http://www.basic.northwestern.edu/biotools/oligocalc.html这个网址上的软件测试一下,GC含量38-60就可以,再看看有没有互补或高级结构。

xiexie.
3楼2014-03-13 22:55:43
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zhangyunjing

金虫 (小有名气)

★ ★ ★
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-03-14 09:22:24
根据相关参数,建议选择第2对引物,self complementarity和self 3' complementarity对应的数值越小越好,非特异性扩增和引物二聚体就越少。另外,将对应的引物在primer blast里检测其特异性,检测出的模板越单一越好
rainwater
4楼2014-03-14 09:13:29
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