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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2025级博士研究生招生报考通知
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小星丹925

木虫 (著名写手)


[交流] PCR优化如何除去出二聚体

最近PCR出来这个结果,希望懂PCR的帮帮忙,给提提建议,我应该怎么优化一下
我的目的条带第一个图是100bp,条带出了但很浅,且有二聚体,还模带,是哪里有问题呢?
第二个图是132bp的目的基因,也是条带出了 但很浅,而且有二聚体
PCR体系是 95度5min 94度30s,梯度退火30s,72度20s 终延伸10min 循环30次
温度梯度分别是图一 52-57.6(primer推荐最佳温度是50),图二 53.2-60.1(primer推荐最佳温度是53度)
希望大家帮帮忙,给点建议 非常感谢
PCR优化如何除去出二聚体
IL-4 100bp.jpg


PCR优化如何除去出二聚体-1
IFN-r 132bp.jpg
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不叶珏

铁杆木虫 (正式写手)


引用回帖:
6楼: Originally posted by 小星丹925 at 2013-12-23 09:15:20
我的引物是引用外国发的SCI文章的,
第一次P出来了,效果还行,后来就再也P不出了
引物我加的是浓度10umol的 1微升 应该减少到多少呢?
非常感谢...

2~5um 终浓度 试试
13楼2013-12-23 09:58:34
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achonghello

金虫 (正式写手)


★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
小星丹925: 金币+2, 谢谢你的帮助 那我应该将退火温度提高到多少度呢?循环次数减少到多少比较好呢? 2013-12-22 15:54:31
提高退火温度或者减少循环次数。。。
2楼2013-12-22 15:18:39
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不叶珏

铁杆木虫 (正式写手)


★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
小星丹925: 金币+2, 谢谢 2013-12-23 09:13:18
少加引物

要根本上解决 重新设计引物
4楼2013-12-22 17:24:00
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woshishui916

木虫 (著名写手)


★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
小星丹925: 金币+2 2013-12-23 09:17:57
1、做个Touch-Down PCR吧
应该能够解决;
2、可以考虑二次扩增;
有问题再联系
5楼2013-12-22 18:49:51
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2013-12-23 09:20   回复  
引用回帖:
3楼: Originally posted by westlife911 at 2013-12-22 16:50:48

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