| 查看: 2534 | 回复: 7 | |||
lwk5716铁杆木虫 (正式写手)
|
[求助]
关于荧光定量PCR引物设计的问题
|
|
如题，我有一个疑问，就是我现在有一些转录组测序的序列，但是只是部分序列，还没有全长，但是我想QRT-PCR。设计引物时用测得的序列设计，但是总是没有完美的，有二聚体，有的有错配。扩出来效果不好，但是用primer5找不出好的，是不是我的序列只是部分的？还是这段序列没有符合荧光定量条件要求的引物位点？要是这样该怎么办啊？ [ 发自手机版 http://muchong.com/3g ] |
回复此楼» 猜你喜欢
Fexaramine：肠道限制性FXR化学探针，结构特征与信号通路研究全解析
已经有0人回复
-
NVS-STG2：靶向STING跨膜域的分子胶类激动剂，结构特征与寡聚化机制研究全解析
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有139人回复
-
DOTA-GPC3肽（CAS 3066439-94-6）：双功能分子探针前体的结构特征与标记应用解析
已经有0人回复
-
科研用 TLR7/8 双激动剂怎么选？现货与质控要点
已经有0人回复
-
SEL120-34A HCl：CDK8/CDK19高选择性激酶抑制剂
已经有0人回复
-
氢氧化钾活化操作
已经有18人回复
-
散金
已经有68人回复
-
生物质超级电容器
已经有0人回复
-
ALK5 高选择性小分子 LY-3200882：可放大合成路线与质控要点解析
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- PCR引物设计问题，求教大神~
已经有11人回复
- 求教一个关于荧光定量PCR的问题
已经有6人回复
- 跟大家请教一个荧光定量PCR的问题
已经有7人回复
- 实时荧光定量PCR过程问题
已经有11人回复
- 求助荧光定量引物验证？
已经有3人回复
- 新人做qRT-PCR 引物怎么设计？
已经有5人回复
- 关于荧光定量PCR基因扩增的问题
已经有5人回复
- 定量PCR-引物二聚体问题
已经有5人回复
- QPCR之引物设计(二)
已经有10人回复
- 求助荧光定量PCR统计方法
已经有7人回复
- 关于实时荧光定量引物设计
已经有5人回复
- SYBR荧光定量的溶解曲线
已经有10人回复
- 大家做RT-qPCR设计引物用的什么软件呀？
已经有15人回复
- 合适的荧光定量PCR管
已经有11人回复
- 荧光定量PCR。。。求助求助
已经有17人回复
- 实时荧光定量PCR仪器使用问题
已经有5人回复
- 求高手指点：RT-PCR的引物设计
已经有18人回复
- 荧光定量PCR与普通PCR产物不一样？
已经有6人回复
- 荧光定量PCR(相对定量)的分析结果2-△△Ct怎么看呀?
已经有31人回复
- 【求助/交流】荧光定量PCR与半定量的RT－PCR在设计引物时有什么区别？
已经有8人回复
- 【求助/交流】求助关于荧光定量PCR染料问题
已经有6人回复
- 【求助/交流】荧光定量PCR引物跨内含子的问题
已经有9人回复
- 【求助/交流】荧光定量PCR中组织保存问题
已经有15人回复
- 【分享】荧光定量PCR实验指南（一）
已经有20人回复
yang0071
木虫 (职业作家)
- 应助: 207 (大学生)
- 金币: 1573.4
- 散金: 9319
- 红花: 21
- 帖子: 4041
- 在线: 647.7小时
- 虫号: 50941
- 注册: 2004-07-15
- 性别: GG
- 专业: 生物化学
2楼2013-11-29 09:34:33
lwk5716
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 7 (幼儿园)
- 金币: 6993.4
- 散金: 181
- 红花: 3
- 帖子: 412
- 在线: 92.7小时
- 虫号: 2628224
- 注册: 2013-09-01
- 性别: GG
- 专业: 作物分子育种
3楼2013-11-29 15:17:21
lwk5716
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 7 (幼儿园)
- 金币: 6993.4
- 散金: 181
- 红花: 3
- 帖子: 412
- 在线: 92.7小时
- 虫号: 2628224
- 注册: 2013-09-01
- 性别: GG
- 专业: 作物分子育种
4楼2013-11-29 21:40:47
lwk5716
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 7 (幼儿园)
- 金币: 6993.4
- 散金: 181
- 红花: 3
- 帖子: 412
- 在线: 92.7小时
- 虫号: 2628224
- 注册: 2013-09-01
- 性别: GG
- 专业: 作物分子育种
5楼2013-12-26 16:20:35
| 做荧光定量最好用web primer这是网址：http://www.yeastgenome.org/cgi-bin/web-primer。primer5有个缺点，不管怎么样都会出来引物，而web primer只有付合要求才能设计出引物，这样就要求自己选择合适的片段来设计引物，而这样设计出来的引物表现也是非常出色的~~另外不知道楼主的研究对象没有基因组信息，如果有建议进行外显子分区，然后将引物设计成跨外显子的。 |
6楼2014-06-04 17:01:26
lwk5716
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 7 (幼儿园)
- 金币: 6993.4
- 散金: 181
- 红花: 3
- 帖子: 412
- 在线: 92.7小时
- 虫号: 2628224
- 注册: 2013-09-01
- 性别: GG
- 专业: 作物分子育种
7楼2014-06-06 21:26:22
8楼2014-06-08 23:50:13
5