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求高手帮忙解答荧光定量PCR融解曲线、标准曲线和样品浓度问题
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jxmingcyl
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专业: 环境微生物学
[
求助
]
求高手帮忙解答荧光定量PCR融解曲线、标准曲线和样品浓度问题
最近一直在做定量PCR,跑了很多次,总是出现问题,求高手帮忙解决
表样和DNA样品26.jpg
标样溶解曲线.png
标样和样品扩增曲线.png
标准曲线.png
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1楼
2013-11-28 10:25:15
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distant616
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专业: 环境工程
【答案】应助回帖
★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流
2013-11-28 12:45:49
标准曲线做的还是挺好的,不过样品怎么好像是没有目的片段的扩增呢?引物,换一下引物可以考虑一下?
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2楼
2013-11-28 11:56:01
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niil
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性别: GG
专业: 生物信息学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+4, 鼓励交流
2013-11-28 12:45:58
从熔解曲线上看,引物质量挺好,稍微有一点二聚体,可以降低一点引物的使用量。
标准曲线做的很不好。你使用的标准样品浓度太高,Ct值都小于10。你的阈值设的有点高,阈值最好设置在产物刚刚快速增加的区间,要符合实时定量的数学模型.
做好一个标准曲线,标准样品的浓度需要好好的去做梯度稀释。使得各梯度的样品Ct值在15-28的区间比较好,你的标准样品太集中了,没有代表性。
最后获得的标准曲线的slope应该在-3.32左右,扩增效率才能达到100%。
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Stop fighting,let it flow.
3楼
2013-11-28 12:25:55
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zzl2516
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注册: 2011-07-07
专业: 环境生物物理
【答案】应助回帖
★ ★
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gyesang: 金币+2, 鼓励交流!
2013-11-28 17:01:26
你这标线线性虽然很好但是扩增效率和斜率都不满足要求啊,而且你样品根本没在标线范围内啊。。这标线是在定什么。。。把标线稀释到样品的范围内吧。。在从新调引物和模板浓度应该就行了
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4楼
2013-11-28 15:15:30
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jhhj2011
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虫号: 3633311
注册: 2015-01-07
专业: 植物病理学
请问你这个是绝对定量吗 ?你的引物和DNA分别加的是多少啊,我最近也在做这个但是标准曲线一直做不好
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5楼
2015-06-03 14:30:06
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