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三蛰

铜虫 (小有名气)

[求助] blast后的identity

氨基酸比对后发现与其他生物的同源基因的氨基酸identity只有有54%,这样能认为我得到的基因就是我要的。
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我不会!
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三蛰

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by xiaoyi-1988 at 2013-11-21 09:18:32
初步可以断定为同源了,我们在研究蛋白功能时通过氨基酸序列比对一般序列相同度达到40%,我们就会对其是否就有相关功能加以用实验的方法对其研究,比对后整体序列相同度不高时,楼主可以看一下局部相同度是否高,然 ...

谢谢!局部有不少同源性较高的保守区!最近查了文献觉得您说的对!谢谢拉!
我不会!
5楼2013-11-21 20:38:10
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三蛰

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by kernim at 2013-11-20 22:16:39
不能吧,我们比对都要相似度98%左右的,还要看一个cover吧

cover是97
我不会!
6楼2013-11-21 20:40:23
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