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mmcniu

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[求助] 含有稀有密码子的基因想在大肠杆菌中做原核表达，Rosetta菌株

RaCC results:

Red = rare Arg codons AGG, AGA, CGA
Green = rare Leu codon CTA
Blue = rare Ile codon ATA
Orange = rare Pro codon CCC

其中含有一个CGA，Rosetta也不能解决这个问题（其他的都ok），该怎么办呢？我要放弃原核表达吗？

第一次做这方面实验，请有经验的多多帮助，谢谢！！！

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1楼 2013-10-27 23:04:33

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mmcniu

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引用回帖:

5楼: Originally posted by bleach060452 at 2013-10-28 11:53:08
你这个稀有密码子，也不一定完全不能表达但产量肯定很少。可以考虑同义突变，或者干脆换真核表达

谢谢！您提到的同义突变，是指设计这个位置相应的引物，用PCR把片段扩出来吗？

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7楼2013-10-28 22:51:12

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bleach060452

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myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰，手有余香。分子生物期待你更多精彩 2013-10-28 12:18:38
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mmcniu: 金币+1, ★★★很有帮助, 3x 2013-10-30 21:17:56

你这个稀有密码子，也不一定完全不能表达但产量肯定很少。可以考虑同义突变，或者干脆换真核表达

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岂能尽如人意，但求无愧我心

5楼2013-10-28 11:53:08

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phoenix211

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【答案】应助回帖

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gyesang: 金币+1, 鼓励交流！ 2013-10-29 01:13:20
mmcniu: 金币+2, ★★★很有帮助, 3x 2013-10-30 21:18:12

如果不想换系统的话楼主试试突变给替换掉吧

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6楼2013-10-28 15:13:24

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wilzu

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【答案】应助回帖

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mmcniu: 金币+1, ★★★很有帮助, 3x 2013-10-30 21:18:25

为什么不考虑双宿主的codon optimization，然后再做基因合成？

[ 发自小木虫客户端 ]

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8楼2013-10-28 23:21:50

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