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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 求大神指点 不同种类的大肠杆菌对密码子的偏好性有声么影响？
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ybdxwd

铜虫 (小有名气)

[求助] 求大神指点 不同种类的大肠杆菌对密码子的偏好性有声么影响？

本人在此网站查得不同种类的大肠杆菌对密码子的偏好性有一定影响  求解！！！
http://www.kazusa.or.jp/codon/cg ... ichia+coli+&c=s
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1楼2012-07-28 21:38:26
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ybdxwd

铜虫 (小有名气)
给力啊！
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2楼2012-07-29 16:20:42
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dshlove

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
ybdxwd: 金币+5 2012-07-30 12:11:39
大肠杆菌毕竟是原核表达系统，而我们时常要表达的蛋白都是真核的蛋白，编码的密码子都是真核常用的。
但是大肠杆菌相对于真核来说毕竟不是高级的表达系统，很多密码子使用就有偏好了，就像一种氨基酸有多种编码，但是有的编码就使用的少，有些就频繁一些。
而且，不同的大肠杆菌本身就是有差别，所以对密码子也是有偏好的，就是萝卜白菜各有所爱嘛。
所以，你在选择好大肠杆菌种类之后就要按照那个宿主的偏好去优化你的目的基因的密码子了。
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3楼2012-07-30 10:03:29
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ybdxwd

铜虫 (小有名气)
http://www.kazusa.or.jp/codon/cg ... ichia+coli+&c=s
从此网站中 查看的 例如：Escherichia coli O127:H6 [gbbct]: 1中的O127:H6 是大肠杆菌携带的不同抗原 他们对密码子的偏好性有什么影响
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4楼2012-07-30 12:10:46
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ybdxwd

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by dshlove at 2012-07-30 10:03:29
大肠杆菌毕竟是原核表达系统，而我们时常要表达的蛋白都是真核的蛋白，编码的密码子都是真核常用的。
但是大肠杆菌相对于真核来说毕竟不是高级的表达系统，很多密码子使用就有偏好了，就像一种氨基酸有多种编码，但 ...

http://www.kazusa.or.jp/codon/cg ... ichia+coli+&c=s
从此网站中 查看的 例如：Escherichia coli O127:H6 [gbbct]: 1中的O127:H6 是大肠杆菌携带的不同抗原 他们对密码子的偏好性有什么影响
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5楼2012-07-30 12:12:28
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dshlove

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by ybdxwd at 2012-07-30 12:12:28
http://www.kazusa.or.jp/codon/cg ... ichia+coli+&c=s
从此网站中 查看的 例如：Escherichia coli O127:H6 : 1中的O127:H6 是大肠杆菌携带的不同抗原 他们对密码子的偏好性有什么影响...

抗原？我没做过抗体方面。
我的理解是，如果表达的蛋白会和抗体有特异性反应，那么就会影响表达该蛋白的氨基酸的密码子。至于怎么影响，我不知道，不能在这瞎说。
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6楼2012-07-30 12:28:24
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ybdxwd

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by dshlove at 2012-07-30 12:28:24
抗原？我没做过抗体方面。
我的理解是，如果表达的蛋白会和抗体有特异性反应，那么就会影响表达该蛋白的氨基酸的密码子。至于怎么影响，我不知道，不能在这瞎说。...

很谢谢了
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7楼2012-07-30 15:09:33
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dshlove

木虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by ybdxwd at 2012-07-30 15:09:33
很谢谢了...

客气了
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8楼2012-07-30 15:32:53
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sd3824289

木虫 (正式写手)
有影响的！这个要看具体的物种所使用的表达系统和大肠杆菌的表达系统使用的密码子是不是一样，如果不一样的话，就要考虑一下突变了！（如果做克隆的话）
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坚持，就像流星，即使知道最后的结果，也要勇敢的走到最后！
9楼2012-07-31 09:09:11
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