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101202139

铜虫 (小有名气)

[求助] 膜蛋白表达问题

我最近在做原核生物的膜蛋白在大肠杆菌中的表达,大致是将目的基因克隆到pET-30a的表达载体上,然后转化到BL21-DE3的感受态细胞中,诱导表达,通过SDS-PAGE电泳,观察结果。可是现在的问题是根本就没有目的蛋白条带,所以求有经验的虫友们不吝赐教。不胜感激……
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vivi625

金虫 (初入文坛)

★ ★
dhd997(金币+2): 安慰一下,继续努力 2011-07-30 13:22:00
我之前做的也是表达不出蛋白,貌似和楼主的一样,前面做的都没什么问题,测序的结果也正常,可是就是跑SDS-PAGE的时候没有我想的条带.....悲催的...
9楼2011-07-27 10:35:18
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莫名Zoe

新虫 (初入文坛)

★ ★ ★ ★ ★
dhd997(金币+5): 第一帖,欢迎多来交流哦 2011-08-04 13:17:42
我也是这个问题……一样的载体,克隆都成了,但是就是蛋白表达不成
10楼2011-08-03 22:46:38
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普通回帖

gwbk

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
dhd997(金币+5, MolEPI+1): good 2011-07-25 19:53:20
101202139(金币+4): 2011-07-25 20:13:40
正在做这方面实验,你的情况说的不是很清楚。
1,通过别的手段鉴定是否表达,如构建的克隆基因有某方面功能可以直接用于筛选。我现在做的从克隆构一直做到抗性筛选成功,底物浓度从0-0.5,平板抗性梯度很明显~
2,菌体PCR或者提质粒PCR验证,提质粒酶切验证。
3,测序。
把前期工作做好,然后开始诱导表达。
4,蛋白电泳
    诱导浓度:IPTG诱导过夜诱导,浓度0.5mM,37℃,在加IPTG诱导的同时加0.1M的底物增大选择压力。
5,离心除去菌液上清,加PBS,菌体超声破碎,一部分离心分为破碎上清和沉淀,一部分跑全蛋白。理论上膜蛋白跑全蛋白就行。
6,优化诱导条件。括温度、时间等。你可以搜索一下论坛,很多这方面的帖子。
2楼2011-07-25 16:52:24
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gwbk

木虫 (正式写手)

★ ★
amisking(金币+2): 鼓励应助 2011-07-25 20:42:57
如果37℃过夜都不表达,其他温度诱导也不会太理想吧?~
膜蛋白做起来难啊。

这是pET手册的内容:
温度
37℃生长常常会使一些蛋白累积形成包涵体,而30℃生长则可能产生可溶的和有活性的蛋白(Schein and Noteborn, 1989)。如果你打算利用一些pET 载体中的信号肽序列输出蛋白的话,在25℃或30℃生长和培养可能是最优化的。在某些情况下,低温(15-20℃)延长诱导时间(过夜)可以使溶解性蛋白的产量达到最大。
3楼2011-07-25 19:40:39
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101202139

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by gwbk at 2011-07-25 16:52:24:
正在做这方面实验,你的情况说的不是很清楚。
1,通过别的手段鉴定是否表达,如构建的克隆基因有某方面功能可以直接用于筛选。我现在做的从克隆构一直做到抗性筛选成功,底物浓度从0-0.5,平板抗性梯度很明显~
...

首先,克隆肯定是没有问题的。酶切验证过,而且也测过序列,完全正确。
其次,在诱导表达蛋白时,我的膜蛋白A大小是37.5KD,跑SDS-PAGE,发现有差不多大小的蛋白,另外我又做了膜蛋白B的表达(目的大小是53.1KD),跑SDS-PAGE,没有目的条带,而且发现膜蛋白A的胶图与膜蛋白B的胶图很类似。所以很有可能是我的表达系统的问题,下一步就选择一种普通的蛋白作为对照,发现膜蛋白A的目的大小条带也在普通蛋白胶图上。总而言之,膜蛋白A、膜蛋白B在表达宿主菌中均没有表达。不知道是什么情况?
最后,你说的“我现在做的从克隆构一直做到抗性筛选成功,底物浓度从0-0.5,平板抗性梯度很明显~”这句话没有太明白。我的目的基因没有某方面的功能。
本人是新手,还望多多指点……
4楼2011-07-25 20:13:03
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101202139

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by gwbk at 2011-07-25 19:40:39:
如果37℃过夜都不表达,其他温度诱导也不会太理想吧?~
膜蛋白做起来难啊。

这是pET手册的内容:
温度
37℃生长常常会使一些蛋白累积形成包涵体,而30℃生长则可能产生可溶的和有活性的蛋白(Schein and Not ...

现在的问题不是蛋白有没有可溶性的问题,而是蛋白有没有表达的问题。
5楼2011-07-25 20:17:28
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ztiger

金虫 (小有名气)

★ ★
dhd997(金币+2): 可以说的详细一下? 2011-07-30 13:21:04
有些膜蛋白确实无法表达,你加上增加可溶性的标签蛋白试一下。
6楼2011-07-25 21:55:16
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gwbk

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
西瓜(金币+3, MolEPI+1): 很有条理,再次奖励! 2011-07-25 23:27:35
就是从得到该基因,克隆至载体,转化大肠杆菌TransT1,提质粒再次转化目的菌株,然后做抗性梯度验证这个过程。
我做的是某氨基酸输出蛋白,是一种膜蛋白,约200aa,抗性梯度很漂亮,涉及专利。因为表达这个输出蛋白,肯定会引起菌体对该氨基酸有较大抗性,所以使用含有不同浓度该氨基酸的平板验证是否有抗性。我已经验证出2个基因了。
还是有些问题的。
1,如果某一个pET不表达,一系列的pET可能都不表达,有些人这么认为,我没有经历过,供你参考。为什么pET不表达,这个。。。好难啊,我也不知道。
2,膜蛋白确定可以表达?某些基因难表达,或不表达~我去,这个,有点难以接受啊,有相关资料吗?可以查一下。
3,原核生物的膜蛋白合不合适BL21表达。
如果是上述原因,建议换基因,换载体。
4,得到蛋白质序列,做密码子优化。这一步或许可以解决很多问题。因为某原核膜蛋白密码子肯定不同于大肠杆菌密码子,我做的这个膜蛋白是通过基因合成的方式得到的:NCBI得到蛋白质序列——根据宿主(大肠杆菌)优化密码子(优化后的密码子NCBI比对跟原核酸序列没有任何相关性)——克隆表达,有用rosetta(de3菌株)的,可以表达稀有密码子。
5,western blot 看是不是真的木有表达。
6,有木有异源信号肽?膜蛋白信号肽可能影响表达。
7,有木有可能是二聚体或多聚体,你再看看?
8,突变造成的终止或不表达,pET载体突变造成的不表达也不能排除(转化到pET后测序正确可以排除这个)。
9,优化各种条件,甚至包括培养条件,摇床转速,诱导时间,诱导温度。

纠结的膜蛋白~
7楼2011-07-25 23:05:37
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darwinxie

铁杆木虫 (职业作家)

自强瓜族族长-----呆瓜大叔

★ ★
dhd997(金币+2): 欢迎多来交流哦 2011-07-30 13:21:34
直接订个膜蛋白纯化kit就可以了
一切都会好的,雨后的天空更加明朗!人生苦短,快乐至上,加油!
8楼2011-07-26 09:25:59
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