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fuyuandj86

版主 (著名写手)

己所不欲,勿施于人

[求助] SDS-PAGE泳道形状诡异

跑SDS-PAGE把细胞裂解液上样结果跑出来这么奇怪的形状(最右边两个泳道)
我可以保证不是胶制备的问题, 换了好几块胶了
上样的时候其他的泳道都没问题,就是只要把这个细胞裂解液加上去,对应的泳道就肯定就跑成这鬼样子
电解缓冲液也没问题, 实验室其他人拿我配的缓冲液跑都没事
大概就是这裂解液样品的问题....请问这是不是盐浓度太高了?还是盐浓度太低了?我这里面还有少量NP-40,不应该影响吧?大概还会残留一些养细胞用的MEM...
见了鬼了,按理说我这缓冲液最多只是PBS
SDS-PAGE泳道形状诡异
yf_6_131_linker_pulldown_cbb.jpg
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同东中郎将

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2013-10-05 17:01:36
fuyuandj86: 金币+4, ★★★很有帮助 2013-10-06 01:08:52
这位同学,你的上样量太大了的结果,可以把你的样品先稀释一下再上样。先稀释5倍看看吧,不行的话少上一点,上样量蛋白太多了。
曾子曰:“士不可以不弘毅,任重而道远。仁以为己任,不亦重乎?死而后已,不亦远乎?”
2楼2013-10-05 08:57:35
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feipiaolw

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+3, 鼓励回帖交流! 2013-10-05 17:01:43
fuyuandj86: 金币+2, 有帮助 2013-10-06 01:09:07
上样量太大,或者把裂解液过滤纯化下再电泳。
学术一点,挺好的,要坚持
3楼2013-10-05 09:24:45
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yonghuixie

禁虫 (小有名气)

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+1, 鼓励回帖应助! 2013-10-05 17:01:50
fuyuandj86: 金币+2, 有帮助 2013-10-06 01:09:28
本帖内容被屏蔽

4楼2013-10-05 14:28:51
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ljj0720

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
fuyuandj86: 金币+2, 有帮助 2013-10-06 01:09:38
你试试离心取上清上样
5楼2013-10-05 21:29:07
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chancety

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
样品制备的问题,不是跑胶的问题,建议重新做样品再跑胶看看

[ 发自手机版 https://muchong.com/3g ]
set up my company!
6楼2013-10-06 01:07:25
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makubex83

至尊木虫 (知名作家)

上样量太大,逐步两倍的稀释一下,跑一下就知道了
7楼2013-10-06 23:05:39
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

楼主的样品电泳时不仅带非常宽甚至可以说是弥散,所以不可能是段春上样过多的问题,样品处理的也不好。电压也可考虑调整。
1.样品处理(充分溶解样品):根据样品分离目的不同,在上样前对样品进行的溶解处理主要有三种处理方法:还原SDS处理、非还原SDS处理、带有烷基化作用的还原SDS处理。
(1)还原SDS处理:在上样buffer中加入SDS和DTT(或Beta巯基乙醇)后,蛋白质构象被解离,电荷被中和,形成SDS与蛋白相结合的分子,在电泳中,只根据分子量来分离。一般电泳均按这种方式处理,样品稀释适当浓度,加入上样Buffer,离心,沸水煮5min,再离心加样。
(2)带有烷基化作用的还原SDS处理:碘乙酸胺的烷基化作用可以很好的并经久牢固的保护SH基团,得到较窄的谱带;另碘乙酸胺可捕集过量的DTT,而防止银染时的纹理现象。100μl样品缓冲液中10μl 20%的碘乙酸胺,并在室温保温30min。
(3)非还原SDS处理:生理体液、血清、尿素等样品,一般只用1%SDS沸水中煮3min,未加还原剂,因而蛋白折叠未被破坏,不可作为测定分子量来使用。
2.保持各种蛋白质样品和Marker在上样前能够充分溶解,上样前最好离心一下,实在溶解不掉的颗粒就去掉。
3.减少上样量,楼主的样品应该稀释十倍后再上样。
4.可以考虑加高电泳时,浓缩胶的电压为90-100 V,分离胶的电压到120V-200V,;浓缩胶和分离胶有时候可能都设成150 V也能电泳成功。
5.上样前要煮沸样品蛋白质。
8楼2013-10-07 15:01:11
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

更准确的回答:

楼主的电泳问题是SDS电泳带弥散、拖尾,原因和解决方法如下(我今天下午刚写好的材料):

SDS电泳带弥散和拖尾的原因和改进措施(2013-10-7)

1.原因一:上样量过多,应该减少上样量。对策:加样体积根据样品浓度和凝胶厚度灵活掌握。一般上样体积为10-15µL(即2-10µg蛋白质)。如果样品很稀上样量可以达到100µL。
2.原因二:样品溶解不完全。
对策:
(1)样品应该充分溶解:保持各种蛋白质样品和Marker在上样前能够充分溶解,上样前最好离心一下,实在溶解不掉的颗粒就去掉。
(2)可以根据分子量标准的蛋白质试剂盒的要求加入样品溶解液;如果是自行配置标准和未知样品,按照0.5-1.0mg/L样品溶解液。溶解后,将其转移至Eppendorf管,盖上盖子(可以在盖子处加上卡子)后在110度沸水中水浴加热3分钟(可以在薄泡沫塑料板上钻出几个与Eppendorf管直径形同的圆洞,Eppendorf管放下去直到盖子边缘约束不能再往下为止,把薄泡沫塑料板的暴露出Eppendorf管的管体大部分的那一面放入沸水浴锅中,薄泡沫塑料板自然飘在沸水表面,便于取用和加热,也可避免沸水溅起。可以一批对于多个Eppendorf管进行不同时间的沸水浴。不要把Eppendorf管扔进沸水浴锅中,盖子可能会被冲开),而后在室温下冷却待用。如果较长时间不用,则将样品放入零下20度冰箱中储存,需用时在取出后使用前在110度沸水中加热3分钟室温冷却后再上样,以去掉样品蛋白质中的亚稳态聚合体。
(3)改变样品缓冲溶液使得样品能够充分溶解,SDS 用量要充分。
9楼2013-10-07 16:26:50
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