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bob1987

铁虫 (初入文坛)

[交流] QPCR引物设计

大家好，
   我设计了一对引物想检测两种不同的剪接体，这两个剪接体只是外显子1不同，其他都一样。参见和后面的序列图。
我为了让他们跨外显子，因此在外显子1和2的交界处设计引物。我设计的引物如下：
  a上游：5’-GAG TGA CAT AGA GTG TGC TGC-3‘
   a下游：5’-GGT CAC TGG AAG ATA TGG C-3‘
   c上游：5’-CTA TGC TGC T GTG TGC TG-3‘
   c下游：5’-GGT CAC TGG AAG ATA TGG C-3‘
上游引物中蓝色区域与红色区域是相同的而且是在外显子2中，其他是在不同的外显子1中，他们的下游是一样的。我想问一下以cDNA为模板，用这两个引物扩出来的产物会一样吗？
这是序列图以及上游引物的位置：
QPCR引物设计
图片3.jpg

[ Last edited by bob1987 on 2013-9-2 at 20:15 ]
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1楼 2013-09-02 19:56:48
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