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33ggdf

新虫 (小有名气)

[求助] 酶切连接 (难题一个接一个呀)

我在做Sac1和Xho1的双酶切连接(这两个酶切位点应该没啥问题吧 ?),分别用这两个酶对表达载体和T载体进行双酶切过夜(NEB的酶 标注说过夜不会产生星活性),T载体上我还加了保护碱基,然后分别切胶回收表达载体的大片段和T载体上的目的片段(两个片段都很亮,大小也合适,大片段约16k,目的片段1100bp),大片段浓度是150纳克/微升,小片段是33纳克/微升,然后做连接(连接是用的NEB的普通连接酶,16度16小时),共20微升体系(1微升连接酶,连接酶我用的是新的;2微升10×连接buffer,也换过新的; 共做了三个比例即大片段与目的片段两者的摩尔比是1:6  1:10   和1:15),再进行热击转化涂皿,分别做了阳性对照(很多单菌落)和阴性对照(无单菌落)可以证明感受态及转化过程没问题,双酶切也成功。可为什么我的连接反应却一个单菌落也长不出来呢(抗性和浓度也没问题),哪位高人帮帮忙???最近快烦死了。。。。。
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eulota

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
33ggdf: 金币+2 2013-09-02 19:16:27
kx444555: 金币+5, 鼓励交流 2013-09-04 16:34:48
gyesang: 回帖置顶 2013-09-04 21:51:51
太巧了,我正好也在用这两个酶做双酶切连接。
前面有人提到的解决方法是对的:载体酶切处理后一定要脱磷处理,因为SacI和XhoI是同尾酶,产生相同的粘性末端!

但是,这个说法不是解决楼主问题的首要方法,看楼主的描述是连接产物转化产生不了任何单菌落,这问题就大了。
我的疑点,仅供参考:
1. 我很怀疑你的载体是不是有问题,可以分别用SacI和XhoI对载体进行单酶切处理,然后加上不酶切的载体做对照,看看你的载体是否真的能被切开,如果不能被切开,说明有两个可能,一是载体错了,二是载体上酶切位点不好用了;
2. 你说你做了阳性对照,阳性对照是什么呢?有没有做这样一个必要的对照:用空载体同步转化,它在平皿上能正常生长。如果不能,也说明你的载体是错误的,这能很好解释为什么你的连接转化产物什么都不长;
3. 再有一点是,前面大家有人提到SacI和XhoI是同尾酶,如果你的载体没有脱磷处理,理论上上会产生大量的自连,那么在你的转化涂板的平皿上应该看到很多菌落才对。你看不到,也说明你的载体很可能是错误的;
4. 抗性问题,楼主自己已经注意了,我就不多说了。

祝好!
8楼2013-09-02 17:20:33
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查看全部 18 个回答

suhsia

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香。分子生物期待更详细的解答 2013-08-31 18:20:44
33ggdf: 金币+1 2013-09-02 08:16:37
换个人做一下就行了,克隆这东西手气很重要,没设么技术含量的

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2013-08-31 16:23:24
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cr507

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
33ggdf: 金币+1 2013-09-02 08:16:45
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-09-04 16:34:57
首先用这两个酶做双酶切是不合适的,它们产生相同的粘性末端,跟单酶切没什么分别,理论上会导致大量的载体自连。另外建议楼主缩短酶切时间试试,NEB的酶按说明书的体系切2小时就足够了。其他应该没什么问题,祝好运!
3楼2013-09-01 21:22:30
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ykluuniu

金虫 (小有名气)


kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-09-04 16:35:18
gyesang: 回帖置顶 2013-09-04 21:52:20
引用回帖:
3楼: Originally posted by cr507 at 2013-09-01 21:22:30
首先用这两个酶做双酶切是不合适的,它们产生相同的粘性末端,跟单酶切没什么分别,理论上会导致大量的载体自连。另外建议楼主缩短酶切时间试试,NEB的酶按说明书的体系切2小时就足够了。其他应该没什么问题,祝好运 ...

不同的酶,切出来的是不同的粘性末端,为什么和单酶切没有区别呢?你说的显然是不对的。
载体自连可能是因为双酶切过程中,有一个酶酶切不彻底的缘故。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
4楼2013-09-01 22:46:12
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