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敏sunflower

金虫 (小有名气)

[求助] 用服务器进行分子模拟,原子数达到上万个是否可以

最近在做嵌段共聚物的分子模拟,对于单体,原子数就已经达到546个,若是聚合度=10,所建晶胞中聚合物链数=2,总原子数就已经过万,我的服务器是24核的,具体属性在附件中。
我想请问各位高手,原子数过万时,服务器能否进行正常计算?对服务器有没有大的损坏?[ 来自小组 寂寞大虫家族 ]
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  • 2013-08-29 18:32:45, 15.25 K

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yaozhq

金虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 敏sunflower at 2013-09-01 10:06:10
那请问你算过的最大体系原子数有多少呐?
对于我要研究的内容,构建嵌段共聚物应该不能使用粗粒化模型吧?
非常感谢您的帮助!!...

不知道你用的什么软件 不过一般而言 MD对原子数没硬性限制 基本上就多一些就算的慢一点而已 不像QM会解不出来  一般做蛋白质模拟加上水都是几万到几十万之间原子数了 材料方面我不熟悉 不过应该有做体系更大的(百万以上) 这时候就要考虑内存够不够 还有就是电脑的散热和供电一定要保证好 剩下的就是等结果啦
9楼2013-09-02 10:09:23
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sciencejoy

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
敏sunflower: 金币+2, 有帮助 2013-08-30 09:35:00
两根嵌段共聚物链模拟能研究什么?即便是做稀溶液中单链问题,两根也太少了。计算量太大,可以用粗粒化模型来模拟。
2楼2013-08-29 20:27:48
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敏sunflower

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by sciencejoy at 2013-08-29 20:27:48
两根嵌段共聚物链模拟能研究什么?即便是做稀溶液中单链问题,两根也太少了。计算量太大,可以用粗粒化模型来模拟。

我是要用嵌段共聚物来做渗透汽化过程的模拟,包括吸附和扩散过程。看到的文献上面,没有关于嵌段共聚物用于渗透汽化过程的模拟,有关渗透汽化模拟的文献中使用的也都是像PVA这类简单的聚合物,即使在聚合度较大的时候原子数也不会太大。
我看了一些关于嵌段共聚物模拟的文献,一般是在考察它在稀溶液中的自组装行为,并用到粗粒化模型。但是在我所做的渗透汽化过程中应该不可以吧?
还希望您能够指点一下。非常感谢您的帮助!
3楼2013-08-30 09:33:29
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sciencejoy

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 敏sunflower at 2013-08-30 09:33:29
我是要用嵌段共聚物来做渗透汽化过程的模拟,包括吸附和扩散过程。看到的文献上面,没有关于嵌段共聚物用于渗透汽化过程的模拟,有关渗透汽化模拟的文献中使用的也都是像PVA这类简单的聚合物,即使在聚合度较大的时 ...

我不懂渗透汽化。瞎问下。你用的嵌段高分子是不是用作渗透气化中的膜,两根链能模拟膜吗?你还是先拿两根链来研究清楚链内相互作用的细节?
4楼2013-08-30 16:25:53
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