24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 3331  |  回复: 11

herarysara

木虫 (小有名气)

[求助] lammps计算中出现原子距离太近现象

在用lammps计算气体反应时,发现体系中有些分子中键长太短。如氢气分子键长只有0.5,O-H只有0.7等等,体系温度很高;求解决办法。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

meihai3166

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
温度太高只有缩小时间步长了。。这应该是惟一可能的方法,要么就不用
ToughGuy
2楼2013-03-15 00:11:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

meihai3166

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by meihai3166 at 2013-03-15 00:11:28
温度太高只有缩小时间步长了。。这应该是惟一可能的方法,要么就不用

要么就只能用其他方法,这分子动力学的硬伤。
ToughGuy
3楼2013-03-15 00:15:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

herarysara

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by meihai3166 at 2013-03-15 00:11:28
温度太高只有缩小时间步长了。。这应该是惟一可能的方法,要么就不用

原来是0.1已经够小了,改成0.01都出问题,看来没得救了。
4楼2013-03-15 08:53:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

herarysara

木虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by meihai3166 at 2013-03-15 00:15:33
要么就只能用其他方法,这分子动力学的硬伤。...

其他方法是嘛意思?
5楼2013-03-15 08:54:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

倔强的坚果墙

铁杆木虫 (正式写手)

看你的势参数是否能准确表达原子间的作用势,这个不准备跑MD也会出现温度上升很大的情况
像小强一样活着
6楼2013-03-15 09:26:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

meihai3166

木虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by herarysara at 2013-03-15 08:54:09
其他方法是嘛意思?...

准连续介质力学之类的,多尺度方面的方法,能跨越原子尺度到达微观尺度的就行
ToughGuy
7楼2013-03-15 09:51:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

meihai3166

木虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by herarysara at 2013-03-15 08:53:53
原来是0.1已经够小了,改成0.01都出问题,看来没得救了。...

你做了弛豫没,如果弛豫没问题,势输入错误的可能性不大。
另一方面检查作用势是否合理吧,因为大部分的作用势都是在平衡态下拟合的,而且是常温,高温下的情况是否能描述,这个本来就具有争议,但大多人就这么用的。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

ToughGuy
8楼2013-03-15 10:02:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

herarysara

木虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 倔强的坚果墙 at 2013-03-15 09:26:47
看你的势参数是否能准确表达原子间的作用势,这个不准备跑MD也会出现温度上升很大的情况

感谢你的回复;我体系是很普通的CHO元素,作用势应该没问题,估计高温下可能真不适用。
9楼2013-03-15 10:19:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

herarysara

木虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
8楼: Originally posted by meihai3166 at 2013-03-15 10:02:27
你做了弛豫没,如果弛豫没问题,势输入错误的可能性不大。
另一方面检查作用势是否合理吧,因为大部分的作用势都是在平衡态下拟合的,而且是常温,高温下的情况是否能描述,这个本来就具有争议,但大多人就这么用 ...

感谢回复,我做过弛豫的,而且是缓慢升温,到目标温度后用的nve,当体系开始反应后,急剧升温达到上万K,感觉是温度失控了,不知道怎样控制;如果是高温下,怎么判定势场的适用性?
10楼2013-03-15 10:21:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 herarysara 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 071000生物学调剂 +4 拉提桃 2026-04-06 4/200 2026-04-06 10:01 by barlinike
[考研] 生物与医药273求调剂 +7 荔题南墙 2026-04-05 7/350 2026-04-06 09:26 by 286640313
[考研] 考研调剂 +5 美丽的youth_ 2026-04-04 6/300 2026-04-06 06:57 by houyaoxu
[考研] 308求调剂 +11 倘若起风了呢 2026-04-05 11/550 2026-04-05 23:21 by 来看流星雨10
[考研] 一志愿南航,数一英一学硕317求调剂!! +5 Acaciad 2026-04-04 5/250 2026-04-05 12:31 by 搏击518
[考研] 283分求调剂 +9 试试看呗 2026-04-04 9/450 2026-04-05 10:27 by 果冻大王
[考研] 材料化工306分找合适调剂 +14 沧海轻舟e 2026-04-04 14/700 2026-04-05 09:53 by 朱云虎202
[考研] 311分 22408 求调剂 +3 bing_bot 2026-04-03 3/150 2026-04-05 00:43 by chongya
[考研] 400分求调剂 +3 尴尬且挠头 2026-04-04 3/150 2026-04-04 08:41 by jp9609
[考研] 考研调剂 +3 15615482637 2026-04-03 3/150 2026-04-03 22:50 by ms629
[考研] 322求调剂 +4 FZAC123 2026-04-03 4/200 2026-04-03 20:55 by zhq0425
[考研] 313求调剂 +3 ~微微凉~ 2026-04-03 3/150 2026-04-03 11:25 by 啵啵啵0119
[考研] 273求调剂 +20 李芷新1 2026-03-31 20/1000 2026-04-03 09:58 by linyelide
[考研] 考研调剂 +3 李木子0120 2026-04-02 5/250 2026-04-02 21:45 by dongzh2009
[考研] 土木304求调剂 +4 兔突突突, 2026-04-02 5/250 2026-04-02 21:16 by 兔突突突,
[考研] 一志愿北交大材料工程总分358 +8 cs0106 2026-04-01 9/450 2026-04-02 10:36 by 不吃魚的貓
[考研] 270调剂 +7 maxjxbsk 2026-04-02 7/350 2026-04-02 09:50 by yulian1987
[考研] 377求调剂 +3 RASKIN 2026-04-02 3/150 2026-04-02 09:45 by zzchen2000
[考研] 298求调剂 +4 什么是胖头鱼 2026-03-30 6/300 2026-04-01 22:06 by 客尔美德
[考研] 269求调剂 +4 我想读研11 2026-03-31 4/200 2026-03-31 10:04 by cal0306
信息提示
请填处理意见