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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » lammps计算中出现原子距离太近现象
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herarysara

木虫 (小有名气)

[求助] lammps计算中出现原子距离太近现象

在用lammps计算气体反应时，发现体系中有些分子中键长太短。如氢气分子键长只有0.5，O-H只有0.7等等，体系温度很高；求解决办法。
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1楼 2013-03-14 17:07:02
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herarysara

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by meihai3166 at 2013-03-15 00:11:28
温度太高只有缩小时间步长了。。这应该是惟一可能的方法，要么就不用

原来是0.1已经够小了，改成0.01都出问题，看来没得救了。
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4楼2013-03-15 08:53:53
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herarysara

木虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by meihai3166 at 2013-03-15 00:15:33
要么就只能用其他方法，这分子动力学的硬伤。...

其他方法是嘛意思？
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5楼2013-03-15 08:54:09
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herarysara

木虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 倔强的坚果墙 at 2013-03-15 09:26:47
看你的势参数是否能准确表达原子间的作用势，这个不准备跑MD也会出现温度上升很大的情况

感谢你的回复；我体系是很普通的CHO元素，作用势应该没问题，估计高温下可能真不适用。
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9楼2013-03-15 10:19:09
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herarysara

木虫 (小有名气)
送鲜花一朵
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8楼: Originally posted by meihai3166 at 2013-03-15 10:02:27
你做了弛豫没，如果弛豫没问题，势输入错误的可能性不大。
另一方面检查作用势是否合理吧，因为大部分的作用势都是在平衡态下拟合的，而且是常温，高温下的情况是否能描述，这个本来就具有争议，但大多人就这么用 ...

感谢回复，我做过弛豫的，而且是缓慢升温，到目标温度后用的nve，当体系开始反应后，急剧升温达到上万K，感觉是温度失控了，不知道怎样控制；如果是高温下，怎么判定势场的适用性？
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10楼2013-03-15 10:21:08
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herarysara

木虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by meihai3166 at 2013-03-15 09:51:40
准连续介质力学之类的，多尺度方面的方法，能跨越原子尺度到达微观尺度的就行...

初学，不太明白；不过还是感谢你的帮助。
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11楼2013-03-15 10:22:32
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