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单单VS双双

新虫 (初入文坛)


[交流] 双顺反子 表达载体的构建——求助!

正在构建双顺反子表达载体,用的是pet-32a 有几个问题请教高人指点
1、第一个基因需不需要ATG还是直接用成熟肽,终止密码子需不需要去掉;
2、第二个基因之前除了要加RBS序列还需要添加别的序列吗,ATG是否需要带着;3、第二个基因从哪里开始编码是否RBS会被识别成三联密码子翻译成相应氨基酸;
4、第二个基因不加RBS,第一个基因不加终止密码子,是否会使两条多肽串联起来,这样形式的蛋白经过变性复性能否具有相应的生物学活性(两个多肽,是同一蛋白的两个亚单位)
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单单VS双双

新虫 (初入文坛)


引用回帖:
2楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-08-28 02:29:54
1. 如果你指向表达成熟肽,可以去掉原序列里的信号肽编码序列,但是需要有ATG作为起始密码子。这样表达出来的产物比成熟肽多一个Met。如果你不想把两个基因融合表达,就不要去掉第一个序列的终止密码子。
2. 第二个 ...

感谢老师帮助,受益匪浅,还有几个地方不太明白
1、第一个基因的翻译起始位点应该是载体RBS下游的第一个ATG吧,也就是说在表达我目的片段的氨基酸之前还要表达载体上的氨基酸100多个,这样的话我第一个基因添加ATG的作用是什么呢,第一个基因表达出来的蛋白是不是就是各种Tag 加上我的目的蛋白的融合蛋白?
2、载体两翼都有His.tag有没有必要都保留?
3、第一个基因如果带着终止密码子,第二个基因的转录和翻译会不会受到影响?第二个基因我可以用TAA做终止密码子,不让下游His.tag 表达吗?
3楼2013-08-28 10:18:26
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)


★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
单单VS双双: 金币+5 2013-08-28 10:19:09
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香。分子生物期待你更多精彩 2013-08-28 13:53:06
1. 如果你指向表达成熟肽,可以去掉原序列里的信号肽编码序列,但是需要有ATG作为起始密码子。这样表达出来的产物比成熟肽多一个Met。如果你不想把两个基因融合表达,就不要去掉第一个序列的终止密码子。
2. 第二个基因之前不用加核糖体结合位点。pet-32a用的是强启动子,没有终止子序列的情况下核糖体不会脱落。第二个基因的ATG需要保留,第二个基因就是从其ATG开设表达。
3. 两个序列之间不用保持阅读框,除非你想做成融合蛋白。
3. 融合蛋白是否保留原来的活性的确要看是否正确折叠成独立结构,一般会在两个蛋白之间加linker。
2楼2013-08-28 02:29:54
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)


★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2013-08-28 19:21:27
引用回帖:
3楼: Originally posted by 单单VS双双 at 2013-08-28 10:18:26
感谢老师帮助,受益匪浅,还有几个地方不太明白
1、第一个基因的翻译起始位点应该是载体RBS下游的第一个ATG吧,也就是说在表达我目的片段的氨基酸之前还要表达载体上的氨基酸100多个,这样的话我第一个基因添加AT ...

1. 你可以选择不同的酶切位点克隆来实现表达产物带什么tag。pET-32a的确可以在N端融合多个tag,并且这些tag是可以在纯化后切除的。这种情况,你实际上是先表达出带标签的融合蛋白,所以第一个目的基因的ATG可以不要,但要注意序列的阅读框与前面的融合标签相符,避免移码。
2. his-tag留一个就可以了。载体这样设计是为了克隆方便。有些蛋白的N端或者C端对活性很重要,只有一边的标签纯化出来的蛋白有活性。
3. 第一个基因的终止密码子不会影响第二个基因的表达,有终止密码子可以避免形成融合蛋白。当然如果你想做融合表达的话,应该去掉第一个基因的终止密码子。第二个基因的TAA如果保留,表达出来的蛋白的C端是没有his-tag。
4楼2013-08-28 11:40:12
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单单VS双双

新虫 (初入文坛)


引用回帖:
4楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-08-28 11:40:12
1. 你可以选择不同的酶切位点克隆来实现表达产物带什么tag。pET-32a的确可以在N端融合多个tag,并且这些tag是可以在纯化后切除的。这种情况,你实际上是先表达出带标签的融合蛋白,所以第一个目的基因的ATG可以不要 ...

之前我一直以为RBS序列必须得有呢!确认一下
1、 “没有终止子序列的情况下核糖体不会脱落”您说的这个终止子是指terminator 不是终止密码子是吧?
2、如果涉及到共表达的两个蛋白的纯化是不是两边的His.tag都得保留啊;
5楼2013-08-28 12:38:24
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