24小时热门版块排行榜    

查看: 1479  |  回复: 8

zq347597638

新虫 (小有名气)

[求助] 做DGGE的相关问题

第一次做DGGE,做土壤DNA的 用的引物PCR结果都在250bp左右,想知道到时候DGGE出来后,割胶测序,可能blast出来,会不会序列太短,谢谢!求做过的指教。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

在雨中

金虫 (著名写手)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这么短的引物做DGGE可以 但测徐就没有必要了

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2013-07-29 11:48:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

savetheday

银虫 (小有名气)

可以的,不都是这么做的吗,找出差异的测序就行了
Godbless
3楼2013-07-29 17:05:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lhf903

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
可以的,250bp也可以比对的~
4楼2013-07-29 18:30:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zq347597638

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by lhf903 at 2013-07-29 18:30:09
可以的,250bp也可以比对的~

好的 非常感谢
5楼2013-07-30 10:21:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lance-tan

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
可以测序,做下克隆就行了..
新手入门求各位大神指导
6楼2013-07-30 15:17:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaoyu1014126

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zq347597638: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢 2013-07-31 10:59:59
250bp应该是V2-V3去,你可以选择V6-V8区(约450bp),一般通过比对讲一个序列鉴定到属至少需要400bp左右
7楼2013-07-30 22:50:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

叫我免子

铁虫 (初入文坛)

LS有两位朋友在误导楼主,你所谓的250bp的产物应该是包括GC夹子的338 518V3区的产物吧,你克隆测序要去掉GC夹子的,其实自由180bp左右。可以克隆测序,但是你的测序结果很难匹配到种属信息,而且,genebank不接受小于200bp的基因片段序列提交了。你懂的
代做DNA提取,变形梯度凝胶电泳DGGE,real-timePCR,克隆文库等分子生物学操作。精通CCA、RDA和variancepartitionanalysis等多元统计分析。
8楼2013-07-31 13:01:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zq347597638

新虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 叫我免子 at 2013-07-31 13:01:53
LS有两位朋友在误导楼主,你所谓的250bp的产物应该是包括GC夹子的338 518V3区的产物吧,你克隆测序要去掉GC夹子的,其实自由180bp左右。可以克隆测序,但是你的测序结果很难匹配到种属信息,而且,genebank不接受小 ...

哦哦  是这样的啊  多谢了 我现在订购了V6-V8区域的引物,非常感谢你!
9楼2013-08-01 16:29:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zq347597638 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 23jxep3nCNZb 2026-09-14 3/150 2026-09-15 01:21 by mibUvS8DDCwf
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-15 00:21 by mibUvS8DDCwf
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-15 00:12 by vZfe6xYu34yj
[博后之家] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 4/200 2026-09-14 23:24 by vZfe6xYu34yj
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 3/150 2026-09-14 23:21 by vZfe6xYu34yj
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 5/250 2026-09-14 23:13 by vZfe6xYu34yj
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 3/150 2026-09-14 23:09 by vZfe6xYu34yj
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 6/300 2026-09-14 22:37 by vZfe6xYu34yj
[找工作] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 5/250 2026-09-14 22:13 by vZfe6xYu34yj
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 5/250 2026-09-14 22:12 by vZfe6xYu34yj
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 5/250 2026-09-14 22:01 by vZfe6xYu34yj
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 5/250 2026-09-14 22:00 by vZfe6xYu34yj
[考博] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 5/250 2026-09-14 21:36 by vZfe6xYu34yj
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 5/250 2026-09-14 21:24 by vZfe6xYu34yj
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 7/350 2026-09-14 21:21 by vZfe6xYu34yj
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 3/150 2026-09-14 18:01 by Aj1rhIDL5ixY
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 4/200 2026-09-14 16:13 by Aj1rhIDL5ixY
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +5 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 6/300 2026-09-14 15:21 by Aj1rhIDL5ixY
[基金申请] 求教各位大神:2026教育部人文社科青年基金项目何时公示呀? +5 云宴山人 2026-09-10 7/350 2026-09-14 12:11 by ecnu2013
[教师之家] 浙江师范大学是怎么坑我的 +10 recruit123 2026-09-09 15/750 2026-09-13 10:45 by seaskyy
信息提示
请填处理意见