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[求助] 做DGGE的相关问题

第一次做DGGE，做土壤DNA的用的引物PCR结果都在250bp左右，想知道到时候DGGE出来后，割胶测序，可能blast出来，会不会序列太短，谢谢！求做过的指教。

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1楼 2013-07-29 09:54:57

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引用回帖:

8楼: Originally posted by 叫我免子 at 2013-07-31 13:01:53
LS有两位朋友在误导楼主，你所谓的250bp的产物应该是包括GC夹子的338 518V3区的产物吧，你克隆测序要去掉GC夹子的，其实自由180bp左右。可以克隆测序，但是你的测序结果很难匹配到种属信息，而且，genebank不接受小 ...

哦哦是这样的啊多谢了我现在订购了V6-V8区域的引物，非常感谢你！