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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 做DGGE的相关问题
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zq347597638

新虫 (小有名气)

[求助] 做DGGE的相关问题

第一次做DGGE，做土壤DNA的 用的引物PCR结果都在250bp左右，想知道到时候DGGE出来后，割胶测序，可能blast出来，会不会序列太短，谢谢！求做过的指教。
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1楼 2013-07-29 09:54:57
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xiaoyu1014126

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zq347597638: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢 2013-07-31 10:59:59
250bp应该是V2-V3去，你可以选择V6-V8区（约450bp），一般通过比对讲一个序列鉴定到属至少需要400bp左右
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7楼2013-07-30 22:50:05
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在雨中

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
这么短的引物做DGGE可以 但测徐就没有必要了

[ 发自小木虫客户端 ]
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2楼2013-07-29 11:48:21
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savetheday

银虫 (小有名气)
可以的，不都是这么做的吗，找出差异的测序就行了
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Godbless
3楼2013-07-29 17:05:30
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lhf903

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
可以的，250bp也可以比对的~
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4楼2013-07-29 18:30:09
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