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白开水女孩

金虫 (小有名气)

[求助] PCR重复不出来

pcr做了几次,之前能P出来的,可是现在就是怎样都做不出来了,有时就算做出来条带也是非常的浅,只是为什么呢?12K左右的片段,是我的问题,还是这个确实是重复性不好?
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wangqi1107

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


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白开水女孩(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖应助! 2013-07-26 17:15:43
12K的片段?12000bp?这么长的片段PCR?你的具体条件,PCR好的时候和不好的时候的图片都发过来。
2楼2013-07-26 16:55:57
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

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1949stone: 回帖置顶 2013-07-27 09:09:07
长片段的DNA片段的确不太好扩增

1. 不知道楼主扩增12K这么长的片段,用的是什么模板,基因组DNA还是cDNA模板?模板的质量怎样?

2. 扩增12K的长片段目的是什么呢,是鉴定还是构建表达载体?如果是构建表达载体,有没有考虑过分段扩增克隆呢,然后再把片段fusion起来

3. 可以换一些扩增能力比较强的可以扩长片段的Taq酶试试,比如GoTaq, LA-Taq, Primerstar

4. 可以优化一下体系,在PCR体系里面加一些反应增强剂比如可以加些DMSO至终浓度5%

希望对你有启发!

[ Last edited by gyesang on 2013-7-26 at 17:37 ]
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
3楼2013-07-26 17:34:06
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
确定是12K?直接扩增12K的片段本身就不是件容易的事情,有时候P不出也是正常的。
4楼2013-07-27 00:51:50
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swxlijie

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
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白开水女孩(gyesang代发): 金币+2, 鼓励回帖交流经验! 2013-07-27 20:38:52
很正常。。。。我也时常这样。我P的是6K左右的片段,起初P的条带超级亮,后面就很暗了,各种程序都是相同的。我觉得PCR有点运气成分在,不是太准的,不过可以增加循环数试试
你来我往,慢慢交往
5楼2013-07-27 09:09:17
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biomed_fanyi

新虫 (初入文坛)

感谢参与,应助指数 +1
本帖内容被屏蔽

6楼2013-07-27 11:26:17
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Sthunder

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


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gyesang: 金币+1, 鼓励回帖应助! 2013-07-27 20:39:01
虽然你prc产物有点长,但PCR的重复性还是很好的,出现这种情况多半是引物或者模板除了问题!Best!
互助互励,共奋共进!!
7楼2013-07-27 11:43:02
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375697868

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


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gyesang: 金币+1, 鼓励回帖交流! 2013-07-27 20:39:07
主要PCR房间的通风及清洁,把所要用的耗材重新灭菌,然后把房间打扫一下,酒精消毒台面,紫外灯杀菌等等,弄完再P。
8楼2013-07-27 11:50:08
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yb19841014

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

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我也经常遇到这个问题,可能是扩增后的污染导致的吧。建议所有能换的都换掉,换个房间做
9楼2013-07-28 19:24:59
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丹丹317

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

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PCR仪有时候可能不稳定,含有要扩的片段挺长的,还有可能是酶的问题有时候酶来回的从冰箱里拿出来,也可能活性有所降低
fighting
10楼2013-07-29 12:35:26
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