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duke188

新虫 (初入文坛)

[求助] 梯度PCR退火温度

上游TTACAAGATGGAGCCTCACC(GC含量50%)
Tm(1M Na+):68.2
Tm(50mM Na+):46.6
下游CAAAGAATAACCCAGGACGA(GC含量45%)
Tm(1M Na+):66.2
Tm(50mM Na+):44.6
顺便问下大家,Tm(1M Na+)和Tm(50mM Na+)有什么区别啊?
我该选择哪个Tm啊?
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hyc_charles

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-07-23 08:21:20
PCR退火温度做梯度的话,一般采取从高于TM值10℃的温度开始,比如你的TM值是55℃那么你从65℃开始做梯度。另外可以坐下touch down试试,每个循环降0.7℃或者1℃,一般可以得到目的条带,我是这么做的,供你参考下
不但要做一个优秀的人,更要做一个无可取代的人…
7楼2013-07-22 18:37:31
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