24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
南方科技大学公共卫生及应急管理学院2025级博士研究生招生报考通知
查看: 2711  |  回复: 9

糖泡泡

金虫 (正式写手)

[求助] western blot中古怪的非特异性条带

最近做western blot总受一些非特异性条带的干扰,虽查了好多资料,一一排查,还是没有解决。想问下我的蛋白经过反应后是溶解在酸性溶液里(pH 4.0-6.0),直接加入loading buffer煮沸后电泳转膜显色,酸性溶液中的蛋白直接western blot会是非特异性显色的来源吗?大家还有什么好的建议针对我的非特异性。
Ps,发现从背面看我的特异性条带特别明显,非特异性条带不怎么清楚。但正面看膜的话特异性条带模糊,非特异性条带特别浓,这又是什么原因?
Help!

[ Last edited by 1949stone on 2013-7-5 at 15:59 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kx444555

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, Gifts of roses, hand there are lingering fragrance. Look forward to your wonderful and more detailed answer. 2013-06-28 20:47:54
糖泡泡: 金币+3 2013-07-05 14:07:40
正面背面的问题,难道你的转膜有穿孔现象?可以换张另一批次的PVDF膜再做次看看,
杂带问题一般说来,先稀释样品,做个梯度,如果还有杂带,稀释一抗,做梯度,试试如何,再不行,投诉抗体公司,不是你的错
星陈代谢
2楼2013-06-28 19:39:56
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
糖泡泡: 金币+3 2013-07-05 14:09:30
gyesang: 金币+1, 鼓励回帖应助! 2013-07-05 14:51:24
western中的非特异条带是一抗的原因吧。抗体的特异性不好才会识别其它蛋白。你的抗体是自己做的吗?可以试试纯化一下抗体。
3楼2013-06-29 08:32:20
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

糖泡泡

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by kx444555 at 2013-06-28 19:39:56
正面背面的问题,难道你的转膜有穿孔现象?可以换张另一批次的PVDF膜再做次看看,
杂带问题一般说来,先稀释样品,做个梯度,如果还有杂带,稀释一抗,做梯度,试试如何,再不行,投诉抗体公司,不是你的错

我的非特异性显色的条带比我特异性显色的条带还要明显,只是从背面看的话就相反,而且实验结果不能很好地重复,有时候成功了,没有非特异性条带,有时候就悲剧了,关键是大部分都是悲剧的还有什么好的建议吗?非常感谢!
4楼2013-07-05 14:09:17
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

糖泡泡

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-06-29 08:32:20
western中的非特异条带是一抗的原因吧。抗体的特异性不好才会识别其它蛋白。你的抗体是自己做的吗?可以试试纯化一下抗体。

抗体是买的,其实我做的很简单,就是HRP-亲和素孵育,我的蛋白是带生物素标签的,关键是实验有时候做的出来,有时候又做不出来!郁闷!
5楼2013-07-05 14:11:42
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
糖泡泡: 金币+3 2013-07-05 17:07:07
引用回帖:
5楼: Originally posted by 糖泡泡 at 2013-07-05 14:11:42
抗体是买的,其实我做的很简单,就是HRP-亲和素孵育,我的蛋白是带生物素标签的,关键是实验有时候做的出来,有时候又做不出来!郁闷!...

有可能与上样量和转膜效果有关。你是否做了上样量及抗体稀释倍数的优化?
6楼2013-07-05 15:54:57
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

糖泡泡

金虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-07-05 15:54:57
有可能与上样量和转膜效果有关。你是否做了上样量及抗体稀释倍数的优化?...

非特异性蛋白对应SDS-PAGE条带很浅,但是westernblot条带却很深。我自个应该特异性显色的蛋白其实烤染挺深的,但是转到膜上就很浅,倒是反过来看背面很深,这是为什么呀?还没做过上样量的优化,准备按照你的建议试一下
7楼2013-07-05 17:09:16
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
糖泡泡: 金币+3 2013-07-06 10:45:02
引用回帖:
7楼: Originally posted by 糖泡泡 at 2013-07-05 17:09:16
非特异性蛋白对应SDS-PAGE条带很浅,但是westernblot条带却很深。我自个应该特异性显色的蛋白其实烤染挺深的,但是转到膜上就很浅,倒是反过来看背面很深,这是为什么呀?还没做过上样量的优化 ...

你的意思是说转完膜后你做了染色,发现目的蛋白条带浅?你是否也染了转完膜的胶?你的目的蛋白多大,用的膜的孔径是多少?会不会是转膜条件不合适转过了或者没有转完全?
8楼2013-07-06 00:40:49
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

糖泡泡

金虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-07-06 00:40:49
你的意思是说转完膜后你做了染色,发现目的蛋白条带浅?你是否也染了转完膜的胶?你的目的蛋白多大,用的膜的孔径是多少?会不会是转膜条件不合适转过了或者没有转完全?...

谢谢你的建议!我没有用丽春红染NC膜,就是将样品上了两份,一份跑后的胶用考马斯亮蓝染色,观察上样量,一份直接western。我的目标蛋白是45 k,是经过多种修饰的。非特异性的蛋白是39 K。现在遇到的情况是非特异性蛋白上样量很少,western条带还很深,而我的目标条带相反。理论上我的目的条带比那个非特异性条带要大,更不容易转过,但目的条带在背面看显色更深,正面很浅。应该是转完全了,染过转完膜后的胶,没有东西。
可以跟您在QQ上聊吗?有一些westernblot的问题想请教下,不知道可不可以知道你QQ,非常感谢!
9楼2013-07-06 10:50:51
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
9楼: Originally posted by 糖泡泡 at 2013-07-06 10:50:51
谢谢你的建议!我没有用丽春红染NC膜,就是将样品上了两份,一份跑后的胶用考马斯亮蓝染色,观察上样量,一份直接western。我的目标蛋白是45 k,是经过多种修饰的。非特异性的蛋白是39 K。现在遇到的情况是非特异性 ...

我没有遇到过这种情况。因为western是半定量的,应该是蛋白量越多条带越深。不知道你做western的目的是什么,既然目标蛋白和非特异条带在胶上位置不同,应该可以区分,这种结果也算是可以接受的吧。我几乎不用QQ的。你可以发email给我:cicelyzhang@hotmail.com
10楼2013-07-06 13:42:57
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 糖泡泡 的主题更新
信息提示
请填处理意见