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werty1245

新虫 (初入文坛)

[求助] 总是提不出来细菌基因组DNA 已有1人参与

最近一直手提屎肠球菌的基因组DNA,开始用的是6μl 50mg/ml溶菌酶,37℃3h;10%SDS和蛋白酶K,55℃2h;5M NaCl;酚氯仿异戊醇抽提两次;2倍体积无水乙醇洗脱;75%酒精洗涤,离心,烘干。一直提不出来,后来又用CTAB/NaCl法,也没提出来,谁提出来过,教教我~~~
小妹不胜感激~~~
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lmcyjxs

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-06-09 21:53:14
gyesang: 回帖置顶 2013-06-10 16:56:31
保证提取过程中每一步准备到位。我没提过细菌的,提的都是木本的组织,用的是异硫氰酸胍法,细菌理论上是比较好提的,
1 注意用量要足够
2 注意试剂及试剂配制没有问题
3 注意操作要细心,细菌蛋白含量应该比较多吧,可以结合氯仿多抽几次,提一点,酚氯仿是自己配的吗?注意要用Tris饱和酚
4 可以买个试剂盒试试。
5 提完不要只跑电泳,要去测纯度和浓度去发现问题,比如是否蛋白含量过高,杂质过多影响电泳观察,这完全是可能的,还有是否因为染料过期问题影响观察等等。
每一步都要注意,多总结,多观察。
思路决定出路。。。
5楼2013-06-09 12:17:01
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普通回帖

夏天的普洱茶

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
提完以后测浓度了吗,或者跑过电泳吗?
2楼2013-06-09 10:35:35
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werty1245

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 夏天的普洱茶 at 2013-06-09 10:35:35
提完以后测浓度了吗,或者跑过电泳吗?

跑过电泳,很干净,什么都没有
3楼2013-06-09 11:09:12
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夏天的普洱茶

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
werty1245(gyesang代发): 金币+2, 鼓励回帖交流经验! 2013-06-10 16:56:22
我都是用试剂盒提的,一般不会有问题,有时候DNA浓度有点低。我看过别人的帖子,手提提不出来。也有可能你的浓度太低,用nanodrop测一下
4楼2013-06-09 12:16:38
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他她0328

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
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gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2013-06-10 16:56:39
提基因的时候,酚抽提这一步很重要,要完全混成乳浊液才行,我以前也是一直都提不出来,现在很容易了
6楼2013-06-09 15:09:29
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werty1245

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 他她0328 at 2013-06-09 15:09:29
提基因的时候,酚抽提这一步很重要,要完全混成乳浊液才行,我以前也是一直都提不出来,现在很容易了

混成乳浊液?能说清楚一些吗?
7楼2013-06-09 20:04:35
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werty1245

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 夏天的普洱茶 at 2013-06-09 12:16:38
我都是用试剂盒提的,一般不会有问题,有时候DNA浓度有点低。我看过别人的帖子,手提提不出来。也有可能你的浓度太低,用nanodrop测一下

用的什么试剂盒啊?
8楼2013-06-09 20:09:14
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夏天的普洱茶

木虫 (著名写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by werty1245 at 2013-06-09 20:09:14
用的什么试剂盒啊?...

我用的生工的一个细菌基因组提取试剂盒,跟操作也有关系的,我刚开始老是提不出来,你每一步按照说明做就可以了。祝实验顺利
9楼2013-06-10 14:15:13
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植语

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-06-24 21:32:22
用酚氯仿抽提混匀的时候力度大一点,刚混完后,整管都是乳浊液,不会上下分层,再静置10min,女生就是这样,用力太轻柔,使蛋白很难抽提出来,最后带着基因组一起沉淀了。
10楼2013-06-23 07:50:40
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