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greatqi木虫 (正式写手)
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(TiO2)38的构建求助
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根据文献中构建（TiO2）38 请见图JCC的结构，我就根据TiO2anatase的结构，通过改变cleave 中的top 来求结构与文献中的尽量一致。 然后再去掉对称性，得到（Ti40O78）请见MYphoto，和原来的结构相比较，多了4个原子。可以直接看到确实是多了几个原子，但是有两个O可以确定，另外2个Ti不太确定应该删除哪个地方。请各位多多指教，并指明原因。 还有就是 我这个是对着文献的图一种机械的拼凑的方法，哪位还能提供更好的个更加直接的方法。还有一个疑问就是如果在TiO2表面吸附原子分子，如何去确定分子的活性位点，谢谢了。 MY-photo.jpg  JCC_22983_sm_SuppFig1.jpg |
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huaiji
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5楼2013-05-30 18:11:58
huaiji
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【答案】应助回帖
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greatqi: 金币+5, ★有帮助, 谢谢应助，希望一起探讨探讨文献。 2013-05-30 08:56:52
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流，， 2013-06-03 21:51:56
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本人认为，另外两个Ti应该在与删掉的O相连接，且靠近中心，与原子簇中心为中心对称位置的Ti.至于原因，得看到文献才知道，或与Ti,O成键及其原子数之比有关。楼主是否可以附上文献。 更直接的方法可以据晶体结构信息文件（.cif文件）得到单个晶胞的原子坐标，编写VB或其它小程序计算坐标而得。 如果在TiO2表面吸附原子，比较好办，直接计算吸附原子坐标即可；分子则比较麻烦，还得自己考虑分子极性…… |
2楼2013-05-29 21:36:55
greatqi
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请见一下文献： J. Phys. Chem. B 2000, 104, 10348-10351 P. Persson,*,†,‡ R. Bergstro1m,† and S. Lunell† 谢谢了。 |
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2013-05-30 08:47:29, 203.77 K
3楼2013-05-30 08:49:38
greatqi
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4楼2013-05-30 08:55:06
40