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lijuanshu

铜虫 (正式写手)

[交流] MS构建表面模型

我用MS构建表面模型时，选取7层原子，并取了真空层，由于周期性，真空层的上面也出现了一层原子（如图1），但是写文章的时候我想把这个去掉，如果把这个删掉，最下面一层的原子也就没有了，不知道该怎么操作，还请高手现身，帮忙解决啊。

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月下冰魂

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1楼 2013-01-10 17:48:59
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

书万里

木虫 (著名写手)
★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流，，呵呵，，正解！ 2013-01-14 16:49:40
告诉你一个无耻的办法：微微增加最下面一层的原子的Z坐标，然后用in cell显示模式显示
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lijuanshu
6楼2013-01-10 20:40:03
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书万里

木虫 (著名写手)
★
lijuanshu(金币+1): 谢谢参与
先将这个模型变为非周期性结构就可以了。build-symmetry-non periodic superstructure
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2楼2013-01-10 18:57:38
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lijuanshu

铜虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by 书万里 at 2013-01-10 20:40:03
告诉你一个无耻的办法：微微增加最下面一层的原子的Z坐标，然后用in cell显示模式显示

呵呵，这种“无耻”的方法还真好用啊
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7楼2013-01-10 21:33:26
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普通回帖

月下冰魂

木虫 (正式写手)
★
lijuanshu(金币+1): 谢谢参与
送鲜花一朵
可以先将其make P1,去掉去周期性，然后就可以单个删除咯
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3楼2013-01-10 19:49:08
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lijuanshu

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 书万里 at 2013-01-10 18:57:38
先将这个模型变为非周期性结构就可以了。build-symmetry-non periodic superstructure

谢谢啦，按照你的方法，模型是没有周期性了，同时边晶格线也没有了，我个人看着好乱啊，怎么才能把晶格线加上呢？
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4楼2013-01-10 19:52:48
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lijuanshu

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 月下冰魂 at 2013-01-10 19:49:08
可以先将其make P1,去掉去周期性，然后就可以单个删除咯

但是Make P1的按钮是灰的啊  
并且我用bulk试验了下，Make P1后还是有对称性的，我删掉脚上的一个原子，结构四个脚上的原子都没有了
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月下冰魂
5楼2013-01-10 19:58:06
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月下冰魂

木虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by lijuanshu at 2013-01-10 19:58:06
但是Make P1的按钮是灰的啊  
并且我用bulk试验了下，Make P1后还是有对称性的，我删掉脚上的一个原子，结构四个脚上的原子都没有了...

额。。。不会吧。那你试试把其变为supercell，看看行不行哈
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9楼2013-01-11 11:00:25
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lijuanshu

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 月下冰魂 at 2013-01-11 11:00:25
额。。。不会吧。那你试试把其变为supercell，看看行不行哈...

好像也不行哎
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10楼2013-01-11 20:57:16
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月下冰魂

木虫 (正式写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by lijuanshu at 2013-01-11 20:57:16
好像也不行哎...

确实，我想尽了方法也不行。。。很纠结，要是楼主发现方法了，还请告知哈，谢谢。
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11楼2013-01-12 10:41:47
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Zpffpz

铁杆木虫 (职业作家)
★
lijuanshu(金币+1): 谢谢参与
我们之前发过文章时，这个是没事的
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12楼2013-01-12 22:35:46
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mxiangying

新虫 (小有名气)
★
lijuanshu(金币+1): 谢谢参与
MS建好模型后，输出CIF。然后用VESTA处理图像，想删哪个都行，不会影响其它的原子。
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lijuanshu
13楼2013-01-13 14:03:32
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lijuanshu

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
11楼: Originally posted by 月下冰魂 at 2013-01-12 10:41:47
确实，我想尽了方法也不行。。。很纠结，要是楼主发现方法了，还请告知哈，谢谢。...

5楼的方法很有用哎
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14楼2013-01-15 14:03:05
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lijuanshu

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
12楼: Originally posted by Zpffpz at 2013-01-12 22:35:46
我们之前发过文章时，这个是没事的

好的，谢谢啊
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15楼2013-01-15 14:04:01
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lijuanshu

铜虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
13楼: Originally posted by mxiangying at 2013-01-13 14:03:32
MS建好模型后，输出CIF。然后用VESTA处理图像，想删哪个都行，不会影响其它的原子。

这也是好方法啊
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16楼2013-01-15 14:12:37
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yida

木虫 (小有名气)
★
lijuanshu(金币+1): 谢谢参与
这个问题我也遇到过，加真空层时通过改变vacumn slab 里的slab position可以得到你想要的结果
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17楼2013-01-16 09:24:51
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madboy

银虫 (小有名气)
★
lijuanshu(金币+1): 谢谢参与
去掉周期性是一个办法，但是缺点是不能保存，否则回复原来的周期性较麻烦。
我经常用的方法是：窗口内右击-Display style-lattice-style改成original
多积累实践，会发现MS绝对是一个强大的建模和出图软件。
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18楼2013-01-23 22:12:12
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xw陌上花开

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
16楼的方法很有效!!
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19楼2013-02-27 15:41:16
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wuli8

荣誉版主 (知名作家)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
19楼: Originally posted by xw陌上花开 at 2013-02-27 15:41:16
16楼的方法很有效!!

18楼的方法很有效!!
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20楼2013-12-11 11:18:43
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fyuewen

金虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
发文章完全没有必要去掉这个。做计算的都在知道，这样显示才是正常的
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21楼2013-12-11 12:57:44
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Han_xiaomu

金虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
6楼方法好用，不错
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22楼2013-12-11 13:17:49
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永卟言弃

铁虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
改变显示方式original就行了
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23楼2015-10-20 23:21:20
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xhzha

铁杆木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
显示original可以。究其原因，是最底层刚好处在周期边界上，default模式自然上下都显示。如果不改变显示方式，你只需将所有原子选中， 向上平移一定距离即可。
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24楼2015-10-21 00:14:03
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默默的小虫

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
没必要改变，那个只是显示的问题，你结构优化以后，上面的原子就不会存在了，这是一个周期结构

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25楼2015-10-27 15:58:48
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书万里8楼
2013-01-10 21:54   回复  
引用回帖:
7楼: Originally posted by lijuanshu at 2013-01-10 21:33:26 呵呵，这种“无耻”的方法还真好用啊...

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