应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » MS构建表面模型
251/1返回列表
查看: 7667  |  回复: 24
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

lijuanshu

铜虫 (正式写手)

[交流] MS构建表面模型

我用MS构建表面模型时，选取7层原子，并取了真空层，由于周期性，真空层的上面也出现了一层原子（如图1），但是写文章的时候我想把这个去掉，如果把这个删掉，最下面一层的原子也就没有了，不知道该怎么操作，还请高手现身，帮忙解决啊。

1.png
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

模拟 科研

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

月下冰魂

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2013-01-10 17:48:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

书万里

木虫 (著名写手)
★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流，，呵呵，，正解！ 2013-01-14 16:49:40
告诉你一个无耻的办法：微微增加最下面一层的原子的Z坐标，然后用in cell显示模式显示
赞一下(2人) 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

lijuanshu
6楼2013-01-10 20:40:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

书万里

木虫 (著名写手)
★
lijuanshu(金币+1): 谢谢参与
先将这个模型变为非周期性结构就可以了。build-symmetry-non periodic superstructure
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2013-01-10 18:57:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lijuanshu

铜虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by 书万里 at 2013-01-10 20:40:03
告诉你一个无耻的办法：微微增加最下面一层的原子的Z坐标，然后用in cell显示模式显示

呵呵，这种“无耻”的方法还真好用啊
赞一下(1人) 回复此楼
7楼2013-01-10 21:33:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

月下冰魂

木虫 (正式写手)
★
lijuanshu(金币+1): 谢谢参与
送鲜花一朵
可以先将其make P1,去掉去周期性，然后就可以单个删除咯
赞一下 回复此楼
3楼2013-01-10 19:49:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lijuanshu

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 书万里 at 2013-01-10 18:57:38
先将这个模型变为非周期性结构就可以了。build-symmetry-non periodic superstructure

谢谢啦，按照你的方法，模型是没有周期性了，同时边晶格线也没有了，我个人看着好乱啊，怎么才能把晶格线加上呢？
赞一下 回复此楼
4楼2013-01-10 19:52:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lijuanshu

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 月下冰魂 at 2013-01-10 19:49:08
可以先将其make P1,去掉去周期性，然后就可以单个删除咯

但是Make P1的按钮是灰的啊  
并且我用bulk试验了下，Make P1后还是有对称性的，我删掉脚上的一个原子，结构四个脚上的原子都没有了
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

月下冰魂
5楼2013-01-10 19:58:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月下冰魂

木虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by lijuanshu at 2013-01-10 19:58:06
但是Make P1的按钮是灰的啊  
并且我用bulk试验了下，Make P1后还是有对称性的，我删掉脚上的一个原子，结构四个脚上的原子都没有了...

额。。。不会吧。那你试试把其变为supercell，看看行不行哈
赞一下 回复此楼
9楼2013-01-11 11:00:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lijuanshu

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 月下冰魂 at 2013-01-11 11:00:25
额。。。不会吧。那你试试把其变为supercell，看看行不行哈...

好像也不行哎
回复此楼
10楼2013-01-11 20:57:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月下冰魂

木虫 (正式写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by lijuanshu at 2013-01-11 20:57:16
好像也不行哎...

确实，我想尽了方法也不行。。。很纠结，要是楼主发现方法了，还请告知哈，谢谢。
赞一下 回复此楼
11楼2013-01-12 10:41:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Zpffpz

铁杆木虫 (职业作家)
★
lijuanshu(金币+1): 谢谢参与
我们之前发过文章时，这个是没事的
赞一下 回复此楼
12楼2013-01-12 22:35:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mxiangying

新虫 (小有名气)
★
lijuanshu(金币+1): 谢谢参与
MS建好模型后，输出CIF。然后用VESTA处理图像，想删哪个都行，不会影响其它的原子。
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

lijuanshu
13楼2013-01-13 14:03:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lijuanshu

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
11楼: Originally posted by 月下冰魂 at 2013-01-12 10:41:47
确实，我想尽了方法也不行。。。很纠结，要是楼主发现方法了，还请告知哈，谢谢。...

5楼的方法很有用哎
赞一下 回复此楼
14楼2013-01-15 14:03:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lijuanshu

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
12楼: Originally posted by Zpffpz at 2013-01-12 22:35:46
我们之前发过文章时，这个是没事的

好的，谢谢啊
回复此楼
15楼2013-01-15 14:04:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lijuanshu

铜虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
13楼: Originally posted by mxiangying at 2013-01-13 14:03:32
MS建好模型后，输出CIF。然后用VESTA处理图像，想删哪个都行，不会影响其它的原子。

这也是好方法啊
回复此楼
16楼2013-01-15 14:12:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yida

木虫 (小有名气)
★
lijuanshu(金币+1): 谢谢参与
这个问题我也遇到过，加真空层时通过改变vacumn slab 里的slab position可以得到你想要的结果
赞一下 回复此楼
17楼2013-01-16 09:24:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

madboy

银虫 (小有名气)
★
lijuanshu(金币+1): 谢谢参与
去掉周期性是一个办法，但是缺点是不能保存，否则回复原来的周期性较麻烦。
我经常用的方法是：窗口内右击-Display style-lattice-style改成original
多积累实践，会发现MS绝对是一个强大的建模和出图软件。
赞一下 回复此楼
18楼2013-01-23 22:12:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xw陌上花开

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
16楼的方法很有效!!
赞一下 回复此楼
19楼2013-02-27 15:41:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wuli8

荣誉版主 (知名作家)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
19楼: Originally posted by xw陌上花开 at 2013-02-27 15:41:16
16楼的方法很有效!!

18楼的方法很有效!!
赞一下 回复此楼
20楼2013-12-11 11:18:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fyuewen

金虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
发文章完全没有必要去掉这个。做计算的都在知道，这样显示才是正常的
赞一下 回复此楼
21楼2013-12-11 12:57:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Han_xiaomu

金虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
6楼方法好用，不错
赞一下 回复此楼
22楼2013-12-11 13:17:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

永卟言弃

铁虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
改变显示方式original就行了
赞一下 回复此楼
23楼2015-10-20 23:21:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xhzha

铁杆木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
显示original可以。究其原因，是最底层刚好处在周期边界上，default模式自然上下都显示。如果不改变显示方式，你只需将所有原子选中， 向上平移一定距离即可。
赞一下 回复此楼
24楼2015-10-21 00:14:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

默默的小虫

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
没必要改变，那个只是显示的问题，你结构优化以后，上面的原子就不会存在了，这是一个周期结构

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
25楼2015-10-27 15:58:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
书万里8楼
2013-01-10 21:54   回复  
引用回帖:
7楼: Originally posted by lijuanshu at 2013-01-10 21:33:26 呵呵，这种“无耻”的方法还真好用啊...

相关版块跳转 我要订阅楼主 lijuanshu 的主题更新
251/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +3 5lbyq5wrhb 2026-02-07 4/200 2026-02-08 08:47 by vs90ilomwc
[考博] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +3 5lbyq5wrhb 2026-02-07 4/200 2026-02-08 08:46 by vs90ilomwc
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +3 3rkserf6qr 2026-02-07 5/250 2026-02-08 08:32 by vs90ilomwc
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +5 2h7du0nuhk 2026-02-07 6/300 2026-02-08 08:26 by vs90ilomwc
[考博] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +5 2h7du0nuhk 2026-02-07 6/300 2026-02-08 08:12 by vs90ilomwc
[考博] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 7/350 2026-02-08 08:06 by vs90ilomwc
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 7/350 2026-02-08 07:52 by vs90ilomwc
[找工作] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 7/350 2026-02-08 07:46 by vs90ilomwc
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 8/400 2026-02-08 07:32 by vs90ilomwc
[考博] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 8/400 2026-02-08 07:27 by vs90ilomwc
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 8/400 2026-02-08 07:26 by vs90ilomwc
[硕博家园] 博士延得我，科研能力直往上蹿 +8 偏振片 2026-02-02 8/400 2026-02-08 06:52 by liyeqik
[教师之家] 有院领导为了换新车，用横向课题经费买了俩车 +7 瞬息宇宙 2026-02-04 7/350 2026-02-07 21:47 by tfang
[有机交流] 酰胺脱乙酰基 10+5 chibby 2026-02-03 12/600 2026-02-07 19:29 by 江东闲人
[基金申请] 同年申请2项不同项目，第1个项目里不写第2个项目的信息，可以吗 +4 hitsdu 2026-02-06 4/200 2026-02-07 13:07 by jurkat.1640
[基金申请] 有时候真觉得大城市人没有县城人甚至个体户幸福 +9 苏东坡二世 2026-02-04 10/500 2026-02-07 12:37 by 小毛球
[考博] 天津大学招2026.09的博士生，欢迎大家推荐交流（博导是本人） +4 a793625982 2026-02-05 5/250 2026-02-07 10:57 by a793625982
[公派出国] CSC & MSCA 博洛尼亚大学能源材料课题组博士/博士后招生｜MSCA经费充足、排名优 +4 雨念 2026-02-01 6/300 2026-02-06 23:32 by MelissaPon
[基金申请] 面上项目申报 +3 Tide man 2026-02-01 3/150 2026-02-05 22:56 by god_tian
[教师之家] 遇见不省心的家人很难过 +18 otani 2026-02-03 22/1100 2026-02-04 11:06 by tangmnt
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭