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greatqi

木虫 (正式写手)

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[求助] (TiO2)38的构建求助

根据文献中构建（TiO2）38 请见图JCC的结构，我就根据TiO2anatase的结构，通过改变cleave 中的top 来求结构与文献中的尽量一致。然后再去掉对称性，得到（Ti40O78）请见MYphoto，和原来的结构相比较，多了4个原子。可以直接看到确实是多了几个原子，但是有两个O可以确定，另外2个Ti不太确定应该删除哪个地方。请各位多多指教，并指明原因。还有就是我这个是对着文献的图一种机械的拼凑的方法，哪位还能提供更好的个更加直接的方法。还有一个疑问就是如果在TiO2表面吸附原子分子，如何去确定分子的活性位点，谢谢了。

MY-photo.jpg

JCC_22983_sm_SuppFig1.jpg

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1楼 2013-05-29 16:29:34

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greatqi

木虫 (正式写手)

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引用回帖:

2楼: Originally posted by huaiji at 2013-05-29 21:36:55
本人认为，另外两个Ti应该在与删掉的O相连接，且靠近中心，与原子簇中心为中心对称位置的Ti.至于原因，得看到文献才知道，或与Ti,O成键及其原子数之比有关。楼主是否可以附上文献。
更直接的方法可以据晶体结构信息 ...

请见一下文献：
J. Phys. Chem. B 2000, 104, 10348-10351
P. Persson,*,†,‡ R. Bergstro1m,† and S. Lunell†
谢谢了。

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附件 1 : QuantumChemicalStudyofPhotoinjectionProcessesinDye-SensitizedTiO2Nanoparticles.pdf

2013-05-30 08:47:29, 203.77 K

3楼2013-05-30 08:49:38

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huaiji

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
greatqi: 金币+5, ★有帮助, 谢谢应助，希望一起探讨探讨文献。 2013-05-30 08:56:52
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流，， 2013-06-03 21:51:56

本人认为，另外两个Ti应该在与删掉的O相连接，且靠近中心，与原子簇中心为中心对称位置的Ti.至于原因，得看到文献才知道，或与Ti,O成键及其原子数之比有关。楼主是否可以附上文献。
更直接的方法可以据晶体结构信息文件（.cif文件）得到单个晶胞的原子坐标，编写VB或其它小程序计算坐标而得。
如果在TiO2表面吸附原子，比较好办，直接计算吸附原子坐标即可；分子则比较麻烦，还得自己考虑分子极性……

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