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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】MS构建晶体时，怎么将分子放入晶胞中？
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fineren

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】MS构建晶体时，怎么将分子放入晶胞中？ 已有16人参与

如图所示，首先建立了晶胞（菱形的框），然后将优化后的分子结构放入该晶胞。好像通过cleave可以调整分子在晶胞中的位置，我希望把这个分子刚好放入这个菱形的框中，晶体参数是根据粉末XRD数据填的，应该是对的。但是调节的时候U，V是分别沿着X和Y轴方向移动，无法在XY面内做旋转。请问应该如何调节呢？
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1楼 2011-03-08 16:52:58
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

acridine

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+1): 谢谢指教 2011-03-21 21:39:47
youzhizhe(金币+1): 谢谢交流。 2011-03-21 21:40:08
不妨试试选中分子（不选中边框）后，用shift+鼠标右键拖动
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10楼2011-03-21 20:55:55
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haowenping

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by fineren at 2011-03-08 16:54:34:
抱歉图片上传失败

这个不用把晶胞放入那个框内把!都是一样的
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人有多大胆，地有多大产！
3楼2011-03-08 21:20:15
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普通回帖

fineren

木虫 (正式写手)
抱歉图片上传失败
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2楼2011-03-08 16:54:34
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fineren

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by haowenping at 2011-03-08 21:20:15:
这个不用把晶胞放入那个框内把!都是一样的

需要的，就像图里这样的
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4楼2011-03-09 08:32:45
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lufuwei

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
楼主能把建立晶胞过程说一下么？我做的聚酰亚胺结构跟你的类似，现在不会做啊
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5楼2011-03-15 21:38:57
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guolianshun

铜虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+1): 鼓励交流 2011-03-17 08:21:53
具体做什么结构？不能直接导入吗？手动会有很多错误不容易避免。
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6楼2011-03-16 22:33:54
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mountwar

禁虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
本帖内容被屏蔽
7楼2011-03-17 10:16:49
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fineren

木虫 (正式写手)
★
zzy870720z(金币+1): 鼓励交流 2011-03-19 09:17:40
引用回帖:
Originally posted by guolianshun at 2011-03-16 22:33:54:
具体做什么结构？不能直接导入吗？手动会有很多错误不容易避免。

模拟COF的晶体结构。是用g03优化的结构，然后想用MS模拟晶体结构，没发直接导入
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8楼2011-03-18 16:00:28
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fineren

木虫 (正式写手)
★
youzhizhe(金币+1): 谢谢交流。 2011-03-20 20:42:27
引用回帖:
Originally posted by lufuwei at 2011-03-15 21:38:57:
楼主能把建立晶胞过程说一下么？我做的聚酰亚胺结构跟你的类似，现在不会做啊

建立晶胞的方法你在论坛里搜一下，有一个详细的帖子
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9楼2011-03-20 20:28:50
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