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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】新分子 如何得到其晶胞参数
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nanjinger

至尊木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】新分子 如何得到其晶胞参数 已有5人参与

如题，偶设计了新结构的分子， 用什么方法模拟可得到其相关晶胞参数，从而可以继续MS计算？多谢~
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1楼 2010-10-12 11:48:52
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zzy870720z

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分子？晶胞参数？是分子晶体还是什么？不太明白
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2楼2010-10-12 12:34:40
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nanjinger

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by zzy870720z at 2010-10-12 12:34:40:
分子？晶胞参数？是分子晶体还是什么？不太明白

新结构的物质，目前没被合成，想要利用MS预测其一些性能，由于是新结构，所以数据库没有其相关参数，老板说可以通过模拟得到。不知道怎么弄呢？只有得到基本参数了MS才能继续下去呀~
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3楼2010-10-12 13:58:39
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zzy870720z

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Originally posted by nanjinger at 2010-10-12 13:58:39:

新结构的物质，目前没被合成，想要利用MS预测其一些性能，由于是新结构，所以数据库没有其相关参数，老板说可以通过模拟得到。不知道怎么弄呢？只有得到基本参数了MS才能继续下去呀~

说说都什么参数
用MD退火试试
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4楼2010-10-12 14:01:49
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nanjinger

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by zzy870720z at 2010-10-12 14:01:49:


说说都什么参数
用MD退火试试

构建晶体结构，需要了解空间群，晶格参数和晶体的内坐标。这些偶的新物质都不知道啊~
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5楼2010-10-12 14:22:04
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zzy870720z

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ym23(金币+1):欢迎常来交流 2010-10-12 16:04:10
引用回帖:
Originally posted by nanjinger at 2010-10-12 14:22:04:

构建晶体结构，需要了解空间群，晶格参数和晶体的内坐标。这些偶的新物质都不知道啊~

试试模拟退火
查查这方面文献看看
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6楼2010-10-12 14:25:58
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nanjinger

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by zzy870720z at 2010-10-12 14:25:58:


试试模拟退火
查查这方面文献看看

多谢啦~
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7楼2010-10-12 20:21:57
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carlaty

金虫 (正式写手)
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zzy870720z(金币+1):谢谢交流 2010-10-13 12:58:18
也不会 全新的吧，找找类似的物质的资料参考呗
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8楼2010-10-13 10:12:43
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后天一

木虫 (小有名气)

我们的自由！
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zzy870720z(金币+2):谢谢指点 2010-10-13 12:58:29
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Originally posted by nanjinger at 2010-10-12 11:48:52:
如题，偶设计了新结构的分子， 用什么方法模拟可得到其相关晶胞参数，从而可以继续MS计算？多谢~

既然设计了新结构，那么其结构你已经知道吧，可能是个大概的结构，不知道分子所含原子数多否，如果是小分子可以用第一性原理的方法，如果是大分子就用分子动力学来做。

这里主要涉及到结构的优化，而结构的优化分为局部优化和全局优化。上面所说的退火算法就是一种全局优化，还有一种叫遗传算法，现在用的比较多。
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9楼2010-10-13 10:23:25
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文静8890

铁虫 (初入文坛)

如何得到其晶胞参数的建议

★ ★
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ym23(金币+1):欢迎常来交流 2010-10-13 18:54:02
是不是可以试下用，FIind it这个小软件，建立你的晶胞，然后查找一下相应的参数
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10楼2010-10-13 16:44:54
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