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nanjinger

至尊木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】新分子 如何得到其晶胞参数 已有5人参与

如题,偶设计了新结构的分子, 用什么方法模拟可得到其相关晶胞参数,从而可以继续MS计算?多谢~
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zzy870720z

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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
分子?晶胞参数?是分子晶体还是什么?不太明白
博学、审问、慎思、明辨、笃学
2楼2010-10-12 12:34:40
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nanjinger

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by zzy870720z at 2010-10-12 12:34:40:
分子?晶胞参数?是分子晶体还是什么?不太明白

新结构的物质,目前没被合成,想要利用MS预测其一些性能,由于是新结构,所以数据库没有其相关参数,老板说可以通过模拟得到。不知道怎么弄呢?只有得到基本参数了MS才能继续下去呀~
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3楼2010-10-12 13:58:39
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zzy870720z

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引用回帖:
Originally posted by nanjinger at 2010-10-12 13:58:39:

新结构的物质,目前没被合成,想要利用MS预测其一些性能,由于是新结构,所以数据库没有其相关参数,老板说可以通过模拟得到。不知道怎么弄呢?只有得到基本参数了MS才能继续下去呀~

说说都什么参数
用MD退火试试
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4楼2010-10-12 14:01:49
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nanjinger

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by zzy870720z at 2010-10-12 14:01:49:


说说都什么参数
用MD退火试试

构建晶体结构,需要了解空间群,晶格参数和晶体的内坐标。这些偶的新物质都不知道啊~
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5楼2010-10-12 14:22:04
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zzy870720z

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★ ★
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ym23(金币+1):欢迎常来交流 2010-10-12 16:04:10
引用回帖:
Originally posted by nanjinger at 2010-10-12 14:22:04:

构建晶体结构,需要了解空间群,晶格参数和晶体的内坐标。这些偶的新物质都不知道啊~

试试模拟退火
查查这方面文献看看
博学、审问、慎思、明辨、笃学
6楼2010-10-12 14:25:58
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nanjinger

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by zzy870720z at 2010-10-12 14:25:58:


试试模拟退火
查查这方面文献看看

多谢啦~
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7楼2010-10-12 20:21:57
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carlaty

金虫 (正式写手)

★ ★
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zzy870720z(金币+1):谢谢交流 2010-10-13 12:58:18
也不会 全新的吧,找找类似的物质的资料参考呗
8楼2010-10-13 10:12:43
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后天一

木虫 (小有名气)

我们的自由!

★ ★ ★
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zzy870720z(金币+2):谢谢指点 2010-10-13 12:58:29
引用回帖:
Originally posted by nanjinger at 2010-10-12 11:48:52:
如题,偶设计了新结构的分子, 用什么方法模拟可得到其相关晶胞参数,从而可以继续MS计算?多谢~

既然设计了新结构,那么其结构你已经知道吧,可能是个大概的结构,不知道分子所含原子数多否,如果是小分子可以用第一性原理的方法,如果是大分子就用分子动力学来做。

这里主要涉及到结构的优化,而结构的优化分为局部优化和全局优化。上面所说的退火算法就是一种全局优化,还有一种叫遗传算法,现在用的比较多。
9楼2010-10-13 10:23:25
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文静8890

铁虫 (初入文坛)

如何得到其晶胞参数的建议

★ ★
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ym23(金币+1):欢迎常来交流 2010-10-13 18:54:02
是不是可以试下用,FIind it这个小软件,建立你的晶胞,然后查找一下相应的参数
10楼2010-10-13 16:44:54
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