| 查看: 2779 | 回复: 6 | ||||
congmingbing木虫 (正式写手)
|
[交流]
【求助】用VMD怎样显示3D结构的晶胞呢？ 已有2人参与
|
|
把lammps的dump文件(dump.atom)导入vmd后，可以显示三维晶体结构图，但是没有晶胞，dump文件中已经包含了box boundary,不知道怎样可以在vmd中显示unit cell呢？ 谢谢高手指点！！ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 精华 |
» 猜你喜欢
材料科学与工程320求调剂，080500
已经有9人回复
-
0703化学调剂 348分
已经有10人回复
-
307求调剂
已经有12人回复
-
求调剂
已经有13人回复
-
一志愿211，0703化学305分求调剂
已经有15人回复
-
284求调剂
已经有14人回复
-
材料工程调剂
已经有5人回复
-
287求调剂
已经有12人回复
-
362求调剂
已经有12人回复
-
273求调剂
已经有42人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 用于构建高级结构的聚合物
已经有6人回复
- wien2k中在w2web中如何显示能带结构？
已经有4人回复
- 如果蛋白序列N或者C末端多了6个组氨酸，怎么分析蛋白结构呢？
已经有4人回复
- 求助，同一种材料，算不同结构时，ISIF取几呢
已经有5人回复
- 结构化学的学习用哪本教材好呢？？？？？？？？望大家交流交流
已经有12人回复
- 请问哪个化合物的结构和这四个化合物的结构最接近
已经有11人回复
- 请问晶体结构一致其晶胞参数是否也一致？
已经有7人回复
- 求晶胞结构（六方相二氧化锗）
已经有10人回复
- 为什么晶胞体积大了就不能收结构？
已经有9人回复
- 【求助】怎样从建立三维周期晶胞，然后再切割成纳米结构？？
已经有4人回复
- 【求助】如何显示晶胞结构中的原子编号与空间坐标？
已经有10人回复
- 【求助】怎样用VMD查看DL_POLY的HISTORY文件
已经有4人回复
- 【原创】VMD如何显示晶胞格子
已经有13人回复
- 【求助】如何快速进行晶胞和原胞之间的结构参数的转换
已经有9人回复
2楼2010-07-17 18:34:18
congmingbing
木虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 2089.9
- 散金: 106
- 帖子: 333
- 在线: 412.3小时
- 虫号: 446335
- 注册: 2007-10-29
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
3楼2010-07-19 08:40:45
★ ★ ★ ★
ghcacj(金币+4):谢谢 2010-07-19 10:14:55
congmingbing(金币+2): 2010-07-19 13:28:42
ghcacj(金币+4):谢谢 2010-07-19 10:14:55
congmingbing(金币+2): 2010-07-19 13:28:42
|
加上 molinfo top set alpha a molinfo top set beta b molinfo top set gamma c a b c 为三个角 单位为度 如果嫌麻烦 直接用pbc set {x y z a b c} 就行了 我用的是VMD1.8.7 a轴一定得平行于VMD中的x轴，其它的就随便了。 我已开始在做的时候没遇到什么问题，你说的情况我还真不太清楚，你看看这个方法行不，这是师兄告诉我的。 |
4楼2010-07-19 10:09:14
congmingbing
木虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 2089.9
- 散金: 106
- 帖子: 333
- 在线: 412.3小时
- 虫号: 446335
- 注册: 2007-10-29
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
5楼2010-07-19 13:32:43
6楼2010-07-19 16:25:56
congmingbing
木虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 2089.9
- 散金: 106
- 帖子: 333
- 在线: 412.3小时
- 虫号: 446335
- 注册: 2007-10-29
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
7楼2010-07-19 19:23:55
