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zyblhyzyx

银虫 (著名写手)

[交流] 【求助】如何显示晶胞结构中的原子编号与空间坐标？ 已有6人参与

用MS模拟了一个粉末的晶体结构，现想写出其晶胞结构中各原子的分数坐标，但不知如何导出文件。文件中要对应原子编号及分数坐标.
请高手出手相助，不胜感谢！

[ Last edited by ghcacj on 2011-4-2 at 13:07 ]
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宇宙要能组装就好了！
1楼 2011-04-02 11:42:10
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御剑江湖

荣誉版主 (著名写手)

天池冶海

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zh1987hs(金币+4): 谢谢 2011-04-04 22:43:47
结构建模后导出.cif 文件，可以看到a,b,c ,基矢，各个原子坐标。

但是你要注意有可能输出文件中的C坐标为笛卡尔坐标，而刚开始给的C坐标是分数坐标。

如果是将模型放置在一个大的盒子中，或者计算的体系本来具有周期性，则直接用castep-->calculation-->save file,然后在文件夹下找到隐藏文件.cell，这里面就是分数坐标。
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莫问前尘事，只怜今世缘，承临纵横风，御剑凡尘路，蹉跎浮华，嬉笑洒脱。
2楼2011-04-02 18:54:17
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zyblhyzyx

银虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 御剑江湖 at 2011-04-02 18:54:17:
结构建模后导出.cif 文件，可以看到a,b,c ,基矢，各个原子坐标。

但是你要注意有可能输出文件中的C坐标为笛卡尔坐标，而刚开始给的C坐标是分数坐标。

如果是将模型放置在一个大的盒子中，或者计算的体系本来 ...

非常感谢您的回复，能再问您一个问题吗？在MS中，结构式上的原子编号和名称是如何显示出来的？

如附件图所示，这样的效果如何得到？
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宇宙要能组装就好了！
3楼2011-04-02 22:22:15
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御剑江湖

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天池冶海

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在MS中，结构式上的原子编号和名称,需要自己一个个原子标记。
这样的效果如何得到？需要自己手动构造！
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4楼2011-04-02 22:44:48
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zyblhyzyx

银虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 御剑江湖 at 2011-04-02 22:44:48:
在MS中，结构式上的原子编号和名称,需要自己一个个原子标记。
这样的效果如何得到？需要自己手动构造！

原子的编号是按照什么原则来呢？实在不好意思，对这一块相当不熟悉！
有没有办法从MS里看原子的编号？
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宇宙要能组装就好了！
5楼2011-04-02 22:56:58
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御剑江湖

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天池冶海

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编号根据自己模型的设置走，MSl里可以看到原子编号。
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莫问前尘事，只怜今世缘，承临纵横风，御剑凡尘路，蹉跎浮华，嬉笑洒脱。
6楼2011-04-02 23:02:21
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zyblhyzyx

银虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 御剑江湖 at 2011-04-02 23:02:21:
编号根据自己模型的设置走，MSl里可以看到原子编号。

非常感谢您的热心帮助！
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宇宙要能组装就好了！
7楼2011-04-02 23:13:18
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tongji888

禁虫 (小有名气)
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8楼2011-12-23 15:11:07
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likang198802

银虫 (小有名气)
顶，很有帮助，谢谢！
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9楼2012-09-26 10:04:42
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刘小伟110

木虫 (小有名气)
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引用回帖:
3楼: Originally posted by zyblhyzyx at 2011-04-02 22:22:15
非常感谢您的回复，能再问您一个问题吗？在MS中，结构式上的原子编号和名称是如何显示出来的？

如附件图所示，这样的效果如何得到？

...

请问lz，这种在MS中的编号，你会了吗，还望指教啊，不胜感激，期待您的回复
赞一下 回复此楼
慢慢的思考。。。
10楼2013-12-17 21:50:32
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