24小时热门版块排行榜    

查看: 2910  |  回复: 10

zyblhyzyx

银虫 (著名写手)

[交流] 【求助】如何显示晶胞结构中的原子编号与空间坐标? 已有6人参与

用MS模拟了一个粉末的晶体结构,现想写出其晶胞结构中各原子的分数坐标,但不知如何导出文件。文件中要对应原子编号及分数坐标.
请高手出手相助,不胜感谢!

[ Last edited by ghcacj on 2011-4-2 at 13:07 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

宇宙要能组装就好了!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

御剑江湖

荣誉版主 (著名写手)

天池冶海

优秀版主

★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+4): 谢谢 2011-04-04 22:43:47
结构建模后导出.cif 文件,可以看到a,b,c ,基矢,各个原子坐标。

但是你要注意有可能输出文件中的C坐标为笛卡尔坐标,而刚开始给的C坐标是分数坐标。

如果是将模型放置在一个大的盒子中,或者计算的体系本来具有周期性,则直接用castep-->calculation-->save file,然后在文件夹下找到隐藏文件.cell,这里面就是分数坐标。
莫问前尘事,只怜今世缘,承临纵横风,御剑凡尘路,蹉跎浮华,嬉笑洒脱。
2楼2011-04-02 18:54:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zyblhyzyx

银虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by 御剑江湖 at 2011-04-02 18:54:17:
结构建模后导出.cif 文件,可以看到a,b,c ,基矢,各个原子坐标。

但是你要注意有可能输出文件中的C坐标为笛卡尔坐标,而刚开始给的C坐标是分数坐标。

如果是将模型放置在一个大的盒子中,或者计算的体系本来 ...

非常感谢您的回复,能再问您一个问题吗?在MS中,结构式上的原子编号和名称是如何显示出来的?

如附件图所示,这样的效果如何得到?

宇宙要能组装就好了!
3楼2011-04-02 22:22:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

御剑江湖

荣誉版主 (著名写手)

天池冶海

优秀版主


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
在MS中,结构式上的原子编号和名称,需要自己一个个原子标记。
这样的效果如何得到?需要自己手动构造!
莫问前尘事,只怜今世缘,承临纵横风,御剑凡尘路,蹉跎浮华,嬉笑洒脱。
4楼2011-04-02 22:44:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zyblhyzyx

银虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by 御剑江湖 at 2011-04-02 22:44:48:
在MS中,结构式上的原子编号和名称,需要自己一个个原子标记。
这样的效果如何得到?需要自己手动构造!

原子的编号是按照什么原则来呢?实在不好意思,对这一块相当不熟悉!
有没有办法从MS里看原子的编号?
宇宙要能组装就好了!
5楼2011-04-02 22:56:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

御剑江湖

荣誉版主 (著名写手)

天池冶海

优秀版主


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
编号根据自己模型的设置走,MSl里可以看到原子编号。
莫问前尘事,只怜今世缘,承临纵横风,御剑凡尘路,蹉跎浮华,嬉笑洒脱。
6楼2011-04-02 23:02:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zyblhyzyx

银虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by 御剑江湖 at 2011-04-02 23:02:21:
编号根据自己模型的设置走,MSl里可以看到原子编号。

非常感谢您的热心帮助!
宇宙要能组装就好了!
7楼2011-04-02 23:13:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tongji888

禁虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
本帖内容被屏蔽

8楼2011-12-23 15:11:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

likang198802

银虫 (小有名气)

顶,很有帮助,谢谢!
9楼2012-09-26 10:04:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

刘小伟110

木虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by zyblhyzyx at 2011-04-02 22:22:15
非常感谢您的回复,能再问您一个问题吗?在MS中,结构式上的原子编号和名称是如何显示出来的?

如附件图所示,这样的效果如何得到?

...

请问lz,这种在MS中的编号,你会了吗,还望指教啊,不胜感激,期待您的回复
慢慢的思考。。。
10楼2013-12-17 21:50:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zyblhyzyx 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿211 0703方向310分求调剂 +3 努力奋斗112 2026-03-15 3/150 2026-03-16 16:44 by houyaoxu
[考研] 312求调剂 +3 陌宸希 2026-03-16 4/200 2026-03-16 15:06 by peike
[考研] 294求调剂 +3 Zys010410@ 2026-03-13 4/200 2026-03-15 10:59 by zhq0425
[考研] 中科大材料专硕319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-13 3/150 2026-03-14 18:10 by houyaoxu
[基金申请] 现在如何回避去年的某一个专家,不知道名字 +3 zk200107 2026-03-12 6/300 2026-03-14 17:13 by zk200107
[考研] 一志愿哈工大材料324分求调剂 +5 闫旭东 2026-03-14 5/250 2026-03-14 14:53 by 木瓜膏
[考研] 【0703化学调剂】-一志愿华中师范大学-六级475 +5 Becho359 2026-03-11 5/250 2026-03-14 11:35 by 哦哦123
[考研] 调剂 +3 13853210211 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:47 by JourneyLucky
[考研] 求调剂,一志愿江南大学环境工程085701 +3 Djdjj12 2026-03-10 4/200 2026-03-14 00:31 by JourneyLucky
[考研] 26考研调剂 +3 ying123. 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:18 by JourneyLucky
[考研] 341求调剂 +4 番茄头--- 2026-03-10 4/200 2026-03-13 23:12 by JourneyLucky
[考研] 336求调剂 +6 Iuruoh 2026-03-11 6/300 2026-03-13 22:06 by JourneyLucky
[考研] 26调剂/材料科学与工程/总分295/求收留 +9 2026调剂侠 2026-03-12 9/450 2026-03-13 20:46 by 18595523086
[硕博家园] 085600 260分求调剂 +3 天空还下雨么 2026-03-13 5/250 2026-03-13 18:46 by 天空还下雨么
[考研] 工科278分求调剂 +5 周慢热啊 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:49 by JourneyLucky
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +8 困于星晨 2026-03-12 10/500 2026-03-13 15:42 by ms629
[考研] 274求调剂 +3 S.H1 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:15 by JourneyLucky
[考博] 2026年博士申请 +3 QwQwQW10 2026-03-11 3/150 2026-03-12 17:58 by gxch43
[考研] 哈工大材料324求调剂 +6 闫旭东 2026-03-10 8/400 2026-03-10 22:49 by 星空星月
[考研] 0703化学调剂 +3 三dd. 2026-03-10 3/150 2026-03-10 15:45 by peike
信息提示
请填处理意见