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congmingbing木虫 (正式写手)
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【求助】用VMD怎样显示3D结构的晶胞呢？ 已有2人参与
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把lammps的dump文件(dump.atom)导入vmd后，可以显示三维晶体结构图，但是没有晶胞，dump文件中已经包含了box boundary,不知道怎样可以在vmd中显示unit cell呢？ 谢谢高手指点！！ |
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2楼2010-07-17 18:34:18
congmingbing
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3楼2010-07-19 08:40:45
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ghcacj(金币+4):谢谢 2010-07-19 10:14:55
congmingbing(金币+2): 2010-07-19 13:28:42
ghcacj(金币+4):谢谢 2010-07-19 10:14:55
congmingbing(金币+2): 2010-07-19 13:28:42
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加上 molinfo top set alpha a molinfo top set beta b molinfo top set gamma c a b c 为三个角 单位为度 如果嫌麻烦 直接用pbc set {x y z a b c} 就行了 我用的是VMD1.8.7 a轴一定得平行于VMD中的x轴，其它的就随便了。 我已开始在做的时候没遇到什么问题，你说的情况我还真不太清楚，你看看这个方法行不，这是师兄告诉我的。 |
4楼2010-07-19 10:09:14
congmingbing
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6楼2010-07-19 16:25:56
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7楼2010-07-19 19:23:55
