应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】MS构建晶体时，怎么将分子放入晶胞中？
242/3返回列表上一页123下一页
查看: 9330  |  回复: 23
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

fineren

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by acridine at 2011-03-21 20:55:55:
不妨试试选中分子（不选中边框）后，用shift+鼠标右键拖动

这个方法确实可以移动分子，但是实际构建晶体应该不是这么做的，可能需要改变几个关键原子的坐标，然后就可以把结构单元放入晶胞中。但是不会操作
赞一下 回复此楼
11楼2011-04-04 14:42:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

acridine

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+3): 谢谢指教 2011-04-05 13:36:41
但是这个shift+鼠标移动的过程 其实就是在改变原子坐标啊！
你可以看一下，在使用shift移动之后，各个原子的坐标是发生改变了的。而不像单纯的鼠标移动或旋转，那只是在改变视角而已。另外MS有一个移动工具条可以也实现shift移动的效果，并且可以对选中的原子进行定量的角度或距离移动，应该能实现你所说。至于是先改变分子坐标还是先再建立周期结构，这个没有本质的区别吧，但用这个方法都是可以实现的。
另外如果只是想改变某些原子的坐标，除了上面说的方法之外，直接编辑原子属性也可以
赞一下(2人) 回复此楼
12楼2011-04-04 15:53:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fineren

木虫 (正式写手)
★
franch(金币+1): 鼓励交流 2011-04-05 15:47:51
引用回帖:
Originally posted by acridine at 2011-04-04 15:53:12:
但是这个shift+鼠标移动的过程 其实就是在改变原子坐标啊！
你可以看一下，在使用shift移动之后，各个原子的坐标是发生改变了的。而不像单纯的鼠标移动或旋转，那只是在改变视角而已。另外MS有一个移动工具条可以 ...

非常感谢。但是有鼠标移动精度太差。
看了一些教程，构建晶体通常是先build crystal，然后add atom，但是我的情况是要用g03优化后的分子去建晶体，不知道优化后的分子的原子坐标应该怎么找？
赞一下(1人) 回复此楼
13楼2011-04-04 21:02:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dragon5061

至尊木虫 (正式写手)

学生
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by fineren at 2011-04-04 14:42:49:
这个方法确实可以移动分子，但是实际构建晶体应该不是这么做的，可能需要改变几个关键原子的坐标，然后就可以把结构单元放入晶胞中。但是不会操作

你好问你一个问题，比如说要把金刚石晶体中的C-C键替换为苯环，构建新的晶胞，该怎么办？不胜感激！
赞一下(1人) 回复此楼
相信自己，努力拼搏！
14楼2011-05-04 09:15:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fineren

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by dragon5061 at 2011-05-04 09:15:19:
你好问你一个问题，比如说要把金刚石晶体中的C-C键替换为苯环，构建新的晶胞，该怎么办？不胜感激！

抱歉，我也不会。看看有没有相似的晶胞，能直接拿过来用
赞一下 回复此楼
15楼2011-05-04 10:59:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tanxuerong

铜虫 (初入文坛)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
uuv2010(金币+1): 多谢提示 2012-03-03 22:17:41
先建立晶胞，后输入原子的坐标
赞一下 回复此楼
hard
16楼2012-03-03 21:47:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Yolanda7

捐助贵宾 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
送鲜花一朵
您好！您的问题解决了吗？是怎么解决的？谢啦
赞一下 回复此楼
喜洋洋~
17楼2012-04-04 08:05:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

han456

铁虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
请楼主解释用g03优化分子构型的相关参数如何可以原封不动带入MS中!谢谢
赞一下 回复此楼
18楼2012-08-09 15:16:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cosfrist

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
SHIFT+鼠标中键 移动
赞一下 回复此楼
力学出身搞过生物医学工程的研究计算材料学的医学影像系青椒一枚
19楼2012-08-09 16:42:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

仇小仇

铁虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
送鲜花一朵
请问楼主 是怎么将分子结构放入晶胞中的呢？ 我在做纤维素晶体部分 要构建纤维素晶体分子链 不知能否指导一下？
赞一下 回复此楼
学海无涯
20楼2012-10-13 20:21:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 proton00 的主题更新
242/3返回列表上一页123下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 4/200 2026-02-07 22:24 by ioveiuleh5
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +3 2h7du0nuhk 2026-02-07 4/200 2026-02-07 22:11 by ioveiuleh5
[考博] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +3 2h7du0nuhk 2026-02-07 5/250 2026-02-07 22:06 by ioveiuleh5
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +3 2h7du0nuhk 2026-02-07 5/250 2026-02-07 22:04 by ioveiuleh5
[教师之家] 有院领导为了换新车，用横向课题经费买了俩车 +7 瞬息宇宙 2026-02-04 7/350 2026-02-07 21:47 by tfang
[找工作] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +3 2h7du0nuhk 2026-02-07 5/250 2026-02-07 21:46 by ioveiuleh5
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +3 2h7du0nuhk 2026-02-07 6/300 2026-02-07 21:44 by ioveiuleh5
[考博] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +3 2h7du0nuhk 2026-02-07 6/300 2026-02-07 21:31 by ioveiuleh5
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +3 2h7du0nuhk 2026-02-07 6/300 2026-02-07 21:26 by ioveiuleh5
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +3 2h7du0nuhk 2026-02-07 6/300 2026-02-07 21:11 by ioveiuleh5
[有机交流] 酰胺脱乙酰基 10+5 chibby 2026-02-03 12/600 2026-02-07 19:29 by 江东闲人
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +3 2h7du0nuhk 2026-02-07 3/150 2026-02-07 18:31 by 6ntj4f1rhx
[基金申请] 同年申请2项不同项目，第1个项目里不写第2个项目的信息，可以吗 +4 hitsdu 2026-02-06 4/200 2026-02-07 13:07 by jurkat.1640
[基金申请] 有时候真觉得大城市人没有县城人甚至个体户幸福 +9 苏东坡二世 2026-02-04 10/500 2026-02-07 12:37 by 小毛球
[考博] 天津大学招2026.09的博士生，欢迎大家推荐交流（博导是本人） +4 a793625982 2026-02-05 5/250 2026-02-07 10:57 by a793625982
[公派出国] CSC & MSCA 博洛尼亚大学能源材料课题组博士/博士后招生｜MSCA经费充足、排名优 +4 雨念 2026-02-01 6/300 2026-02-06 23:32 by MelissaPon
[基金申请] 面上项目申报 +3 Tide man 2026-02-01 3/150 2026-02-05 22:56 by god_tian
[硕博家园] 博士延得我，科研能力直往上蹿 +7 偏振片 2026-02-02 7/350 2026-02-04 17:36 by 陈氏帝国
[基金申请] 面上基金申报没有其他的参与者成吗 +5 默默的小虫子 2026-01-31 5/250 2026-02-04 11:26 by 学员fOzRO9
[教师之家] 遇见不省心的家人很难过 +18 otani 2026-02-03 22/1100 2026-02-04 11:06 by tangmnt
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭