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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 如何在ms中添加晶胞中的元素
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yangmomi

金虫 (小有名气)

[求助] 如何在ms中添加晶胞中的元素

已知空间群为pnnm，a=4.72,b=4.17,c=2.92,alpha=beta=gama=90,目前已经加入第一种元素，如何确定abc来加入下一种元素，谢谢
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1楼 2013-01-26 11:36:55
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chaizhm

木虫 (著名写手)
可以先找一下晶胞结构 已知晶胞结构 原子位置还是很好找的
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yangmomi
壁立万仞，无欲则刚
2楼2013-01-26 18:31:47
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yangmomi

金虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by chaizhm at 2013-01-26 18:31:47
可以先找一下晶胞结构 已知晶胞结构 原子位置还是很好找的

如何找原子位置呢，可否说的具体一点，是直接在ms软件里换算吗？晶胞结构是orthorhombic 。谢谢！！！
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3楼2013-01-26 19:32:52
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275560060

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2013-01-27 09:44:40
这个你要知道原子在晶胞里的占位情况，也就是元素坐标。然后 add atom，一个一个的加就可以了。
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yangmomi
修修修
4楼2013-01-27 00:26:38
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yangmomi

金虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by 275560060 at 2013-01-27 00:26:38
这个你要知道原子在晶胞里的占位情况，也就是元素坐标。然后 add atom，一个一个的加就可以了。

我是不知道元素坐标，有什么方法可以找出元素坐标吗？我查找过CCDC,没有。可以通过什么方法算出来吗？已经知道空间群和晶胞结构的构型。谢谢
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5楼2013-01-27 09:10:11
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chaizhm

木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by yangmomi at 2013-01-26 19:32:52
如何找原子位置呢，可否说的具体一点，是直接在ms软件里换算吗？晶胞结构是orthorhombic 。谢谢！！！...

通过百度或googel找这个晶胞晶格排列 一般是可以找到的

或者找这个物质跟哪个相似，如果相似的有，这个也就有了
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壁立万仞，无欲则刚
6楼2013-01-27 09:43:24
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zuozhijun5134

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
楼主的应该是晶体，应该先查到其占位，一个一个添加。
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7楼2013-01-27 10:21:48
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275560060

金虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by yangmomi at 2013-01-27 09:10:11
我是不知道元素坐标，有什么方法可以找出元素坐标吗？我查找过CCDC,没有。可以通过什么方法算出来吗？已经知道空间群和晶胞结构的构型。谢谢...

光知道空间群和晶胞类型是做不出来的。你可以找实验室测一下晶体组分和元素占位。如果你已经知道了组分，不知道具体占位，理论上是可以通过原子弛豫优化得到晶体结构，但这样做的可靠性还是要有试验支撑的。
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修修修
8楼2013-01-27 13:06:48
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