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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » LAMP引物问题
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养活它

新虫 (初入文坛)

[求助] LAMP引物问题

各位大侠，你们好，我初入分子这一领域，想请大家教一下怎么样设计引物，有大体流程即可。谢谢。（以金黄色葡萄球菌为例）
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1楼 2012-12-20 15:05:41
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hylee103

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
用http://primerexplorer.jp/e/在线软件设计引物
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2楼2012-12-20 15:23:21
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养活它

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by hylee103 at 2012-12-20 15:23:21
用http://primerexplorer.jp/e/在线软件设计引物

问题是，我不会找靶基因，在NCBI中怎么查找？自己琢磨半天，仍然不会啊。。
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3楼2012-12-20 16:10:28
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hylee103

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 养活它 at 2012-12-20 16:10:28
问题是，我不会找靶基因，在NCBI中怎么查找？自己琢磨半天，仍然不会啊。。...

在Genbank里输入你要找的基因，种属就可以找到了！
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4楼2012-12-20 16:23:33
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q317476148

铁杆木虫 (著名写手)

喵星人

【答案】应助回帖

搜索文献上提及的引物用于实验的具体步骤：
1.        先搜索与本实验相似或相同文献上提及的目标基因引物序列（以小鼠Mefc为例）；
2.        在http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore网站上搜索“mousemefc”，出现多个搜索结果，选择“MusmusculusmyocyteenhancerfactorC,mRNA(cDNAcloneMGC:IMAGE,”打开后点击“CDS”,出现编码区域的碱基序列。
3.        验证文献引物的正确性：（在word上操作即可）
①“ctrl+F”的对话框中键入F引物，即GCGCAGGGAATGGATACGG，点击确定在全文中搜索此序列，即可找到F引物对应的CDS中的位置；
②“ctrl+F”的对话框中键入R引物配对碱基的’-’方向，即“GCAAGAATAGGGTGGACCGT”,点击确定在全文中搜索此序列，即可找到R引物对应的CDS中的位置。
另注：由于反转录中的模板是mRNA(单链),所以只需要在反转录反应液中加入R引物。
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5楼2012-12-23 16:31:00
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赵云开心哦

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by hylee103 at 2012-12-20 15:23:21
用http://primerexplorer.jp/e/在线软件设计引物

请问一下这个软件怎么用啊，java下哪个呢

发自小木虫Android客户端
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6楼2018-08-14 11:00:38
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