24小时热门版块排行榜    

查看: 2698  |  回复: 6

匿名

用户注销 (著名写手)

总版主

本帖仅楼主可见

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子生化实验经验积累

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   同方向广播   申请MolEPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

sportsgenie

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

首先要做的是尽可能收集多的细菌16S序列进行clustal比对,这样能看到保守区的位置。但完全保守的区域是没有,还是会存在个别碱基的差异,所以还是建议用兼并引物。
2楼2012-12-13 10:42:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zq347597638

新虫 (小有名气)

参考楼上的
3楼2012-12-13 15:31:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dxh708

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

通用引物是不是无法扩增出所有细菌,其实16s全长的引物用27f和1492r就好了,这对引物可扩增出所有的细菌,当然例外的还未发现,这对引物通常用于菌种鉴定,其中也有两个碱基为兼并碱基。该引物序列如下:
27f:AGA GTT TGA TCM TGG CTC AG
1492r:TAC GGY TAC CTT GTT ACG ACT T
dongxioahui
4楼2012-12-29 10:57:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

alan008alan

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by dxh708 at 2012-12-29 10:57:22
通用引物是不是无法扩增出所有细菌,其实16s全长的引物用27f和1492r就好了,这对引物可扩增出所有的细菌,当然例外的还未发现,这对引物通常用于菌种鉴定,其中也有两个碱基为兼并碱基。该引物序列如下:
27f:AGA  ...

我用27L和1492R这对引物扩增两种不同的菌各10株,均纯化过4-5次,电泳出来都有2条带,1500bp左右一条较亮的,1300bp左右一条较浅的,做了两次(细菌DNA提取和PCR都做两次)均是相同情况。
为什么会有两条带啊?可能是什么情况引起的?我要做菌种鉴定的,该怎么办?
5楼2013-01-19 20:51:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小柒_s

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

1、16S扩增引物的效果更好。例如8F (5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3') and reverse primer 533R (5'-TTACCGCGGCTGCTGGCAC-3')这个和其他文章的结果差不多,no rank较少。
2、可真核生物测序为什么在门的水平上出现很多NO Rank和SAR呢,大概占到75%,我的样本是水样,是不是这与引物相关呢,为何查文献其他人的比例没有这么高?
行万里路,读万卷书
6楼2013-10-26 17:46:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yupfei

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

16s可以扩增出肠道的所有细菌把,,有经验的同学给说下,
   还有细菌的相对定量问题
7楼2013-12-08 17:58:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 baiyal2000 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 基金不中,共勉 +3 eulota 2026-08-26 3/150 2026-08-26 16:17 by 路yyyy
[基金申请] 怎么查啊 +5 huang1991js 2026-08-26 5/250 2026-08-26 16:09 by Equinoxhua
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +9 炎黄贵胄 2026-08-22 10/500 2026-08-26 15:40 by semaglutide
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +6 process2012 2026-08-23 9/450 2026-08-26 15:33 by process2012
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +26 yaoyewhu2008 2026-08-20 28/1400 2026-08-26 13:49 by zzuzxg
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +4 yuleib84 2026-08-26 5/250 2026-08-26 13:40 by yuleib84
[基金申请] 科研孤儿太难了 +21 我4大白菜 2026-08-20 22/1100 2026-08-26 11:29 by nlgza
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 国合现在查不到了吗? +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 明天应该可查了!? +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +17 医学老男孩 2026-08-20 22/1100 2026-08-25 15:36 by 医学老男孩
[基金申请] 人气不行了 +11 fansofjerry 2026-08-21 11/550 2026-08-25 11:04 by 孤独的英雄6
[教师之家] 导师吐槽:我怎么摊上了这么个极品研究生! +3 苏东坡二世 2026-08-23 3/150 2026-08-25 10:35 by shisan1313
[基金申请] 我面上完蛋了 +13 且听虎啸 2026-08-20 14/700 2026-08-25 09:10 by mrkang
[基金申请] 让我中一个面上吧! +13 大萍1987 2026-08-20 16/800 2026-08-24 10:23 by 太傻了
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
信息提示
请填处理意见