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thestormcong银虫 (小有名气)
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求助16sv3区结果分析 已有8人参与
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这是本人的16sv3区扩增产物，模板为16spcr全序列，引物为v3区通用引物，结果显示该区很宽，是不是有非特异性扩增，能否直接进行下一步的DGGE，请教各位能够指点，非常感谢！ |
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 【分子生物】EPI帖 |
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
1949stone(MolEPI+1): 鼓励 2011-10-07 23:27:25
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
1949stone(MolEPI+1): 鼓励 2011-10-07 23:27:25
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建议你用QIAGEN的盒子，这个贵点，但是考虑到你对细菌定量的准确性这个绝对物有所值！另外你如果16s出来的结果是单一条带，那理论上出来的出来的应该是单一条带。但是也不排除多种条带的可能。你这个多做几遍试试把。不行的话就整个上胶。不过这个和DGGE的功能优势貌似有点不符~~ 另外说点个人的看法啊，你用基因组扩增16S全长，在这个过程中其实原始细菌的量反应在你PCR结果上应该就不准了，因为通用引物对每种细菌16S的扩增效率是不一样的，这样出来的结果本来就不准确了，然后你在用这个不准的结果再次用DGGE引物扩增，这个貌似就更不靠谱了。所以我个人认为这样做欠妥。个人看法，仅供参考哈。 |
6楼2011-10-07 23:13:17
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13楼2011-10-09 10:22:29
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