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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 无模板pcr合成短片段 一直失败
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wy135033405

木虫 (小有名气)

[求助] 无模板pcr合成短片段 一直失败

在下需要合成的片段为107bp，为了节省开支，设计了6条短引物，以数字大致表示如下（一条链的5' 端为起点，互补链也从该方向计数，加' 表示）：

p1: 1-30  p2：15'-45'  p3: 31-60 p4: 46'-75'  p5: 60-90 p6: 76'-107'

如图

6条引物去除重叠部分可以拼凑成目的片段，目前使用多种酶、体系、反应条件均无法p出目的片段，在不重新设计引物的条件下，请大家提供些意见。本帖只为求助，如果确实通过您的方案做出结果，另赠100金币，绝不食言。

图示
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1楼 2012-07-16 15:29:43
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lihegang2000

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
这么短的片段不需要PCR，两两退火，磷酸化之后连接起来就可以了
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10楼2012-07-16 23:10:46
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lihegang2000

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
wy135033405: 金币+10, ★★★很有帮助, 又一种思路，受益良多。 2012-07-17 16:26:18
小丹木木: 金币+1, 鼓励交流 2012-07-18 13:46:12
引用回帖:
11楼: Originally posted by wy135033405 at 2012-07-17 08:08:08
感谢指导，能否提供具体一点的方案？...

先将p2、p3、p4、p5使用PNK（磷酸激酶）磷酸化并灭活，再将p1与p2、p3与p4、p5与p6分别退火，最后将三者用T4 DNA连接酶连接起来。
赞一下(1人) 回复此楼
22楼2012-07-17 15:16:52
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lihegang2000

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
22楼: Originally posted by lihegang2000 at 2012-07-17 15:16:52
先将p2、p3、p4、p5使用PNK（磷酸激酶）磷酸化并灭活，再将p1与p2、p3与p4、p5与p6分别退火，最后将三者用T4 DNA连接酶连接起来。...

写错了，PNK是多核苷酸激酶
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23楼2012-07-17 15:21:11
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